Salvia roborowskii chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
LSC
IR
SSC
IR
trnH-GUG · MW752206.1 · 12–85 bp · −
psbA · MW752206.1 · 396–1,454 bp · −
trnK-UUU · MW752206.1 · 1,686–4,279 bp · −
matK · MW752206.1 · 1,985–3,547 bp · −
rps16 · MW752206.1 · 4,851–5,966 bp · −
trnQ-UUG · MW752206.1 · 6,931–7,002 bp · −
trnS-GCU · MW752206.1 · 8,222–8,309 bp · −
atpA · MW752206.1 · 10,108–11,631 bp · −
atpF · MW752206.1 · 11,740–12,989 bp · −
atpH · MW752206.1 · 13,264–13,509 bp · −
atpI · MW752206.1 · 14,510–15,253 bp · −
rps2 · MW752206.1 · 15,478–16,188 bp · −
rpoC2 · MW752206.1 · 16,397–20,584 bp · −
rpoC1 · MW752206.1 · 20,742–23,562 bp · −
rpoB · MW752206.1 · 23,589–26,801 bp · −
psbM · MW752206.1 · 29,249–29,353 bp · −
trnD-GUC · MW752206.1 · 29,872–29,945 bp · −
trnY-GUA · MW752206.1 · 30,056–30,139 bp · −
trnE-UUC · MW752206.1 · 30,205–30,277 bp · −
trnS-UGA · MW752206.1 · 34,942–35,034 bp · −
trnfM-CAU · MW752206.1 · 36,073–36,146 bp · −
rps14 · MW752206.1 · 36,291–36,593 bp · −
psaB · MW752206.1 · 36,716–38,920 bp · −
psaA · MW752206.1 · 38,946–41,198 bp · −
ycf3 · MW752206.1 · 41,988–43,925 bp · −
rps4 · MW752206.1 · 45,106–45,711 bp · −
trnT-UGU · MW752206.1 · 46,084–46,156 bp · −
ndhJ · MW752206.1 · 48,267–48,743 bp · −
ndhK · MW752206.1 · 48,854–49,531 bp · −
ndhC · MW752206.1 · 49,583–49,945 bp · −
trnV-UAC · MW752206.1 · 50,886–51,534 bp · −
atpE · MW752206.1 · 51,992–52,393 bp · −
atpB · MW752206.1 · 52,390–53,886 bp · −
psbJ · MW752206.1 · 63,430–63,552 bp · −
psbL · MW752206.1 · 63,682–63,798 bp · −
psbF · MW752206.1 · 63,822–63,941 bp · −
psbE · MW752206.1 · 63,956–64,207 bp · −
trnW-CCA · MW752206.1 · 65,485–65,558 bp · −
trnP-UGG · MW752206.1 · 65,737–65,810 bp · −
rpl20 · MW752206.1 · 67,612–67,998 bp · −
rps12 · MW752206.1 · 68,807–68,920 bp · −
rps12 · MW752206.1 · 96,189–96,972 bp · −
clpP · MW752206.1 · 69,044–70,962 bp · −
psbN · MW752206.1 · 73,284–73,415 bp · −
rpoA · MW752206.1 · 76,792–77,799 bp · −
rps11 · MW752206.1 · 77,871–78,287 bp · −
rpl36 · MW752206.1 · 78,397–78,510 bp · −
infA · MW752206.1 · 78,606–78,839 bp · −
rps8 · MW752206.1 · 78,966–79,370 bp · −
rpl14 · MW752206.1 · 79,557–79,925 bp · −
rpl16 · MW752206.1 · 80,057–81,333 bp · −
rps3 · MW752206.1 · 81,469–82,131 bp · −
rpl22 · MW752206.1 · 82,116–82,583 bp · −
rps19 · MW752206.1 · 82,653–82,931 bp · −
rpl2 · MW752206.1 · 82,991–84,473 bp · −
rpl23 · MW752206.1 · 84,492–84,773 bp · −
trnI-CAU · MW752206.1 · 84,939–85,012 bp · −
trnL-CAA · MW752206.1 · 92,546–92,626 bp · −
ndhB · MW752206.1 · 93,186–95,339 bp · −
rps7 · MW752206.1 · 95,668–96,135 bp · −
trnN-GUU · MW752206.1 · 107,029–107,100 bp · −
ndhF · MW752206.1 · 108,454–110,688 bp · −
ndhD · MW752206.1 · 113,387–114,928 bp · −
psaC · MW752206.1 · 115,026–115,271 bp · −
ndhE · MW752206.1 · 115,522–115,824 bp · −
ndhG · MW752206.1 · 116,042–116,572 bp · −
ndhI · MW752206.1 · 116,960–117,466 bp · −
ndhA · MW752206.1 · 117,547–119,641 bp · −
ndhH · MW752206.1 · 119,643–120,878 bp · −
rps15 · MW752206.1 · 120,924–121,196 bp · −
ycf1 · MW752206.1 · 121,613–127,249 bp · −
trnR-ACG · MW752206.1 · 128,059–128,132 bp · −
rrn5 · MW752206.1 · 128,376–128,496 bp · −
rrn4.5 · MW752206.1 · 128,752–128,854 bp · −
rrn23 · MW752206.1 · 128,955–131,763 bp · −
trnA-UGC · MW752206.1 · 131,929–132,805 bp · −
trnI-GAU · MW752206.1 · 132,870–133,882 bp · −
rrn16 · MW752206.1 · 134,181–135,671 bp · −
trnV-GAC · MW752206.1 · 135,898–135,969 bp · −
ycf15 · MW752206.1 · 142,283–142,531 bp · −
ycf2 · MW752206.1 · 142,622–149,467 bp · −
psbK · MW752206.1 · 7,382–7,561 bp · +
psbI · MW752206.1 · 7,954–8,064 bp · +
trnG-UCC · MW752206.1 · 8,996–9,748 bp · +
trnR-UCU · MW752206.1 · 9,931–10,002 bp · +
trnC-GCA · MW752206.1 · 27,957–28,027 bp · +
petN · MW752206.1 · 28,183–28,272 bp · +
trnT-GGU · MW752206.1 · 30,817–30,888 bp · +
psbD · MW752206.1 · 32,266–33,327 bp · +
psbC · MW752206.1 · 33,275–34,696 bp · +
psbZ · MW752206.1 · 35,369–35,557 bp · +
trnG-GCC · MW752206.1 · 35,829–35,899 bp · +
trnS-GGA · MW752206.1 · 44,743–44,829 bp · +
trnL-UAA · MW752206.1 · 46,822–47,362 bp · +
trnF-GAA · MW752206.1 · 47,661–47,733 bp · +
trnM-CAU · MW752206.1 · 51,715–51,787 bp · +
rbcL · MW752206.1 · 54,650–56,104 bp · +
accD · MW752206.1 · 56,802–58,289 bp · +
psaI · MW752206.1 · 58,764–58,874 bp · +
ycf4 · MW752206.1 · 59,321–59,875 bp · +
cemA · MW752206.1 · 60,486–61,175 bp · +
petA · MW752206.1 · 61,415–62,377 bp · +
petL · MW752206.1 · 64,982–65,077 bp · +
petG · MW752206.1 · 65,257–65,370 bp · +
psaJ · MW752206.1 · 66,062–66,235 bp · +
rpl33 · MW752206.1 · 66,686–66,886 bp · +
rps18 · MW752206.1 · 67,052–67,357 bp · +
rps12 · MW752206.1 · 137,596–138,379 bp · +
psbB · MW752206.1 · 71,411–72,937 bp · +
psbT · MW752206.1 · 73,116–73,223 bp · +
psbH · MW752206.1 · 73,521–73,742 bp · +
petB · MW752206.1 · 73,876–75,225 bp · +
petD · MW752206.1 · 75,419–76,615 bp · +
ycf2 · MW752206.1 · 85,101–91,946 bp · +
ycf15 · MW752206.1 · 92,037–92,285 bp · +
trnV-GAC · MW752206.1 · 98,599–98,670 bp · +
rrn16 · MW752206.1 · 98,897–100,387 bp · +
trnI-GAU · MW752206.1 · 100,686–101,698 bp · +
trnA-UGC · MW752206.1 · 101,763–102,639 bp · +
rrn23 · MW752206.1 · 102,805–105,613 bp · +
rrn4.5 · MW752206.1 · 105,714–105,816 bp · +
rrn5 · MW752206.1 · 106,072–106,192 bp · +
trnR-ACG · MW752206.1 · 106,436–106,509 bp · +
ycf1 · MW752206.1 · 107,319–108,485 bp · +
rpl32 · MW752206.1 · 111,118–111,288 bp · +
trnL-UAG · MW752206.1 · 112,007–112,086 bp · +
ccsA · MW752206.1 · 112,131–113,156 bp · +
trnN-GUU · MW752206.1 · 127,468–127,539 bp · +
rps7 · MW752206.1 · 138,433–138,900 bp · +
ndhB · MW752206.1 · 139,229–141,382 bp · +
trnL-CAA · MW752206.1 · 141,942–142,022 bp · +
trnI-CAU · MW752206.1 · 149,556–149,629 bp · +
rpl23 · MW752206.1 · 149,795–150,076 bp · +
rpl2 · MW752206.1 · 150,095–151,577 bp · +
rps19 · MW752206.1 · 151,637–151,678 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Salvia roborowskii
ANNOTATED PLASTOME
MW752206.1
151,678 bp · 134 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 37920 75839 113758 151678 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN trnT-GGU psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG ycf1 rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2 rps19
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG trnS-GCU atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
135 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 12 85 74 Locate
psbA gene − 396 1454 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1686 4279 2594 Locate
matK gene − 1985 3547 1563 Locate
rps16 gene − 4851 5966 1116 Locate
trnQ-UUG gene − 6931 7002 72 Locate
psbK gene + 7382 7561 180 Locate
psbI gene + 7954 8064 111 Locate
trnS-GCU gene − 8222 8309 88 Locate
trnG-UCC gene + 8996 9748 753 Locate
trnR-UCU gene + 9931 10002 72 Locate
atpA gene − 10108 11631 1524 Locate
atpF gene − 11740 12989 1250 Locate
atpH gene − 13264 13509 246 Locate
atpI gene − 14510 15253 744 Locate
rps2 gene − 15478 16188 711 Locate
rpoC2 gene − 16397 20584 4188 Locate
rpoC1 gene − 20742 23562 2821 Locate
rpoB gene − 23589 26801 3213 Locate
trnC-GCA gene + 27957 28027 71 Locate
petN gene + 28183 28272 90 Locate
psbM gene − 29249 29353 105 Locate
trnD-GUC gene − 29872 29945 74 Locate
trnY-GUA gene − 30056 30139 84 Locate
trnE-UUC gene − 30205 30277 73 Locate
trnT-GGU gene + 30817 30888 72 Locate
psbD gene + 32266 33327 1062 Locate
psbC gene + 33275 34696 1422 Locate
trnS-UGA gene − 34942 35034 93 Locate
psbZ gene + 35369 35557 189 Locate
trnG-GCC gene + 35829 35899 71 Locate
trnfM-CAU gene − 36073 36146 74 Locate
rps14 gene − 36291 36593 303 Locate
psaB gene − 36716 38920 2205 Locate
psaA gene − 38946 41198 2253 Locate
ycf3 gene − 41988 43925 1938 Locate
trnS-GGA gene + 44743 44829 87 Locate
rps4 gene − 45106 45711 606 Locate
trnT-UGU gene − 46084 46156 73 Locate
trnL-UAA gene + 46822 47362 541 Locate
trnF-GAA gene + 47661 47733 73 Locate
ndhJ gene − 48267 48743 477 Locate
ndhK gene − 48854 49531 678 Locate
ndhC gene − 49583 49945 363 Locate
trnV-UAC gene − 50886 51534 649 Locate
trnM-CAU gene + 51715 51787 73 Locate
atpE gene − 51992 52393 402 Locate
atpB gene − 52390 53886 1497 Locate
rbcL gene + 54650 56104 1455 Locate
accD gene + 56802 58289 1488 Locate
psaI gene + 58764 58874 111 Locate
ycf4 gene + 59321 59875 555 Locate
cemA gene + 60486 61175 690 Locate
petA gene + 61415 62377 963 Locate
psbJ gene − 63430 63552 123 Locate
psbL gene − 63682 63798 117 Locate
psbF gene − 63822 63941 120 Locate
psbE gene − 63956 64207 252 Locate
petL gene + 64982 65077 96 Locate
petG gene + 65257 65370 114 Locate
trnW-CCA gene − 65485 65558 74 Locate
trnP-UGG gene − 65737 65810 74 Locate
psaJ gene + 66062 66235 174 Locate
rpl33 gene + 66686 66886 201 Locate
rps18 gene + 67052 67357 306 Locate
rpl20 gene − 67612 67998 387 Locate
rps12 gene − 68807 68920 114 Locate
clpP gene − 69044 70962 1919 Locate
psbB gene + 71411 72937 1527 Locate
psbT gene + 73116 73223 108 Locate
psbN gene − 73284 73415 132 Locate
psbH gene + 73521 73742 222 Locate
petB gene + 73876 75225 1350 Locate
petD gene + 75419 76615 1197 Locate
rpoA gene − 76792 77799 1008 Locate
rps11 gene − 77871 78287 417 Locate
rpl36 gene − 78397 78510 114 Locate
infA gene − 78606 78839 234 Locate
rps8 gene − 78966 79370 405 Locate
rpl14 gene − 79557 79925 369 Locate
rpl16 gene − 80057 81333 1277 Locate
rps3 gene − 81469 82131 663 Locate
rpl22 gene − 82116 82583 468 Locate
rps19 gene − 82653 82931 279 Locate
rpl2 gene − 82991 84473 1483 Locate
rpl23 gene − 84492 84773 282 Locate
trnI-CAU gene − 84939 85012 74 Locate
ycf2 gene + 85101 91946 6846 Locate
ycf15 gene + 92037 92285 249 Locate
trnL-CAA gene − 92546 92626 81 Locate
ndhB gene − 93186 95339 2154 Locate
rps7 gene − 95668 96135 468 Locate
rps12 gene − 96189 96972 784 Locate
trnV-GAC gene + 98599 98670 72 Locate
rrn16 gene + 98897 100387 1491 Locate
trnI-GAU gene + 100686 101698 1013 Locate
trnA-UGC gene + 101763 102639 877 Locate
rrn23 gene + 102805 105613 2809 Locate
rrn4.5 gene + 105714 105816 103 Locate
rrn5 gene + 106072 106192 121 Locate
trnR-ACG gene + 106436 106509 74 Locate
trnN-GUU gene − 107029 107100 72 Locate
ycf1 gene + 107319 108485 1167 Locate
ndhF gene − 108454 110688 2235 Locate
rpl32 gene + 111118 111288 171 Locate
trnL-UAG gene + 112007 112086 80 Locate
ccsA gene + 112131 113156 1026 Locate
ndhD gene − 113387 114928 1542 Locate
psaC gene − 115026 115271 246 Locate
ndhE gene − 115522 115824 303 Locate
ndhG gene − 116042 116572 531 Locate
ndhI gene − 116960 117466 507 Locate
ndhA gene − 117547 119641 2095 Locate
ndhH gene − 119643 120878 1236 Locate
rps15 gene − 120924 121196 273 Locate
ycf1 gene − 121613 127249 5637 Locate
trnN-GUU gene + 127468 127539 72 Locate
trnR-ACG gene − 128059 128132 74 Locate
rrn5 gene − 128376 128496 121 Locate
rrn4.5 gene − 128752 128854 103 Locate
rrn23 gene − 128955 131763 2809 Locate
trnA-UGC gene − 131929 132805 877 Locate
trnI-GAU gene − 132870 133882 1013 Locate
rrn16 gene − 134181 135671 1491 Locate
trnV-GAC gene − 135898 135969 72 Locate
rps12 gene + 137596 138379 784 Locate
rps7 gene + 138433 138900 468 Locate
ndhB gene + 139229 141382 2154 Locate
trnL-CAA gene + 141942 142022 81 Locate
ycf15 gene − 142283 142531 249 Locate
ycf2 gene − 142622 149467 6846 Locate
trnI-CAU gene + 149556 149629 74 Locate
rpl23 gene + 149795 150076 282 Locate
rpl2 gene + 150095 151577 1483 Locate
rps19 gene + 151637 151678 42 Locate
Status Available
Accession MW752206.1
Length 151,678 bp
GC content 38.0%
Annotated genes 134
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 15 Ribosomal Protein 27 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources