Salvia umbratica chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
LSC
IR
SSC
IR
trnH-GUG · MW752208.1 · 12–85 bp · −
psbA · MW752208.1 · 396–1,454 bp · −
trnK-UUU · MW752208.1 · 1,686–4,279 bp · −
matK · MW752208.1 · 1,985–3,547 bp · −
rps16 · MW752208.1 · 4,845–5,960 bp · −
trnQ-UUG · MW752208.1 · 6,949–7,020 bp · −
trnS-GCU · MW752208.1 · 8,232–8,319 bp · −
atpA · MW752208.1 · 10,115–11,638 bp · −
atpF · MW752208.1 · 11,745–12,997 bp · −
atpH · MW752208.1 · 13,264–13,509 bp · −
atpI · MW752208.1 · 14,512–15,255 bp · −
rps2 · MW752208.1 · 15,480–16,190 bp · −
rpoC2 · MW752208.1 · 16,399–20,586 bp · −
rpoC1 · MW752208.1 · 20,744–23,564 bp · −
rpoB · MW752208.1 · 23,591–26,803 bp · −
psbM · MW752208.1 · 29,252–29,356 bp · −
trnD-GUC · MW752208.1 · 29,875–29,948 bp · −
trnY-GUA · MW752208.1 · 30,059–30,142 bp · −
trnE-UUC · MW752208.1 · 30,208–30,280 bp · −
trnS-UGA · MW752208.1 · 34,944–35,036 bp · −
trnfM-CAU · MW752208.1 · 36,075–36,148 bp · −
rps14 · MW752208.1 · 36,293–36,595 bp · −
psaB · MW752208.1 · 36,718–38,922 bp · −
psaA · MW752208.1 · 38,948–41,200 bp · −
ycf3 · MW752208.1 · 41,990–43,927 bp · −
rps4 · MW752208.1 · 45,108–45,713 bp · −
trnT-UGU · MW752208.1 · 46,086–46,158 bp · −
ndhJ · MW752208.1 · 48,268–48,744 bp · −
ndhK · MW752208.1 · 48,855–49,532 bp · −
ndhC · MW752208.1 · 49,584–49,946 bp · −
trnV-UAC · MW752208.1 · 50,888–51,536 bp · −
atpE · MW752208.1 · 51,994–52,395 bp · −
atpB · MW752208.1 · 52,392–53,888 bp · −
psbJ · MW752208.1 · 63,412–63,534 bp · −
psbL · MW752208.1 · 63,664–63,780 bp · −
psbF · MW752208.1 · 63,804–63,923 bp · −
psbE · MW752208.1 · 63,938–64,189 bp · −
trnW-CCA · MW752208.1 · 65,466–65,539 bp · −
trnP-UGG · MW752208.1 · 65,718–65,791 bp · −
rpl20 · MW752208.1 · 67,590–67,976 bp · −
rps12 · MW752208.1 · 68,788–68,901 bp · −
rps12 · MW752208.1 · 96,171–96,954 bp · −
clpP · MW752208.1 · 69,025–70,941 bp · −
psbN · MW752208.1 · 73,263–73,394 bp · −
rpoA · MW752208.1 · 76,771–77,778 bp · −
rps11 · MW752208.1 · 77,850–78,266 bp · −
rpl36 · MW752208.1 · 78,376–78,489 bp · −
infA · MW752208.1 · 78,585–78,818 bp · −
rps8 · MW752208.1 · 78,945–79,349 bp · −
rpl14 · MW752208.1 · 79,538–79,906 bp · −
rpl16 · MW752208.1 · 80,038–81,315 bp · −
rps3 · MW752208.1 · 81,451–82,113 bp · −
rpl22 · MW752208.1 · 82,098–82,565 bp · −
rps19 · MW752208.1 · 82,635–82,913 bp · −
rpl2 · MW752208.1 · 82,973–84,455 bp · −
rpl23 · MW752208.1 · 84,474–84,755 bp · −
trnI-CAU · MW752208.1 · 84,921–84,994 bp · −
trnL-CAA · MW752208.1 · 92,528–92,608 bp · −
ndhB · MW752208.1 · 93,168–95,321 bp · −
rps7 · MW752208.1 · 95,650–96,117 bp · −
trnN-GUU · MW752208.1 · 107,016–107,087 bp · −
ndhF · MW752208.1 · 108,441–110,675 bp · −
ndhD · MW752208.1 · 113,353–114,894 bp · −
psaC · MW752208.1 · 114,993–115,238 bp · −
ndhE · MW752208.1 · 115,489–115,791 bp · −
ndhG · MW752208.1 · 116,009–116,539 bp · −
ndhI · MW752208.1 · 116,920–117,426 bp · −
ndhA · MW752208.1 · 117,507–119,590 bp · −
ndhH · MW752208.1 · 119,592–120,827 bp · −
rps15 · MW752208.1 · 120,873–121,145 bp · −
ycf1 · MW752208.1 · 121,562–127,207 bp · −
trnR-ACG · MW752208.1 · 128,017–128,090 bp · −
rrn5 · MW752208.1 · 128,334–128,454 bp · −
rrn4.5 · MW752208.1 · 128,710–128,812 bp · −
rrn23 · MW752208.1 · 128,913–131,721 bp · −
trnA-UGC · MW752208.1 · 131,887–132,768 bp · −
trnI-GAU · MW752208.1 · 132,833–133,845 bp · −
rrn16 · MW752208.1 · 134,144–135,634 bp · −
trnV-GAC · MW752208.1 · 135,861–135,932 bp · −
ycf15 · MW752208.1 · 142,246–142,494 bp · −
ycf2 · MW752208.1 · 142,585–149,430 bp · −
psbK · MW752208.1 · 7,400–7,579 bp · +
psbI · MW752208.1 · 7,972–8,082 bp · +
trnG-UCC · MW752208.1 · 9,001–9,755 bp · +
trnR-UCU · MW752208.1 · 9,938–10,009 bp · +
trnC-GCA · MW752208.1 · 27,953–28,023 bp · +
petN · MW752208.1 · 28,187–28,276 bp · +
trnT-GGU · MW752208.1 · 30,820–30,891 bp · +
psbD · MW752208.1 · 32,268–33,329 bp · +
psbC · MW752208.1 · 33,277–34,698 bp · +
psbZ · MW752208.1 · 35,371–35,559 bp · +
trnG-GCC · MW752208.1 · 35,831–35,901 bp · +
trnS-GGA · MW752208.1 · 44,745–44,831 bp · +
trnL-UAA · MW752208.1 · 46,824–47,363 bp · +
trnF-GAA · MW752208.1 · 47,662–47,734 bp · +
trnM-CAU · MW752208.1 · 51,717–51,789 bp · +
rbcL · MW752208.1 · 54,652–56,106 bp · +
accD · MW752208.1 · 56,803–58,290 bp · +
psaI · MW752208.1 · 58,765–58,875 bp · +
ycf4 · MW752208.1 · 59,322–59,876 bp · +
cemA · MW752208.1 · 60,487–61,176 bp · +
petA · MW752208.1 · 61,397–62,359 bp · +
petL · MW752208.1 · 64,963–65,058 bp · +
petG · MW752208.1 · 65,238–65,351 bp · +
psaJ · MW752208.1 · 66,043–66,216 bp · +
rpl33 · MW752208.1 · 66,667–66,867 bp · +
rps18 · MW752208.1 · 67,033–67,338 bp · +
rps12 · MW752208.1 · 137,559–138,342 bp · +
psbB · MW752208.1 · 71,390–72,916 bp · +
psbT · MW752208.1 · 73,095–73,202 bp · +
psbH · MW752208.1 · 73,500–73,721 bp · +
petB · MW752208.1 · 73,855–75,204 bp · +
petD · MW752208.1 · 75,398–76,594 bp · +
ycf2 · MW752208.1 · 85,083–91,928 bp · +
ycf15 · MW752208.1 · 92,019–92,267 bp · +
trnV-GAC · MW752208.1 · 98,581–98,652 bp · +
rrn16 · MW752208.1 · 98,879–100,369 bp · +
trnI-GAU · MW752208.1 · 100,668–101,680 bp · +
trnA-UGC · MW752208.1 · 101,745–102,626 bp · +
rrn23 · MW752208.1 · 102,792–105,600 bp · +
rrn4.5 · MW752208.1 · 105,701–105,803 bp · +
rrn5 · MW752208.1 · 106,059–106,179 bp · +
trnR-ACG · MW752208.1 · 106,423–106,496 bp · +
ycf1 · MW752208.1 · 107,306–108,472 bp · +
rpl32 · MW752208.1 · 111,101–111,271 bp · +
trnL-UAG · MW752208.1 · 111,973–112,052 bp · +
ccsA · MW752208.1 · 112,097–113,122 bp · +
trnN-GUU · MW752208.1 · 127,426–127,497 bp · +
rps7 · MW752208.1 · 138,396–138,863 bp · +
ndhB · MW752208.1 · 139,192–141,345 bp · +
trnL-CAA · MW752208.1 · 141,905–141,985 bp · +
trnI-CAU · MW752208.1 · 149,519–149,592 bp · +
rpl23 · MW752208.1 · 149,758–150,039 bp · +
rpl2 · MW752208.1 · 150,058–151,540 bp · +
rps19 · MW752208.1 · 151,600–151,641 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Salvia umbratica
ANNOTATED PLASTOME
MW752208.1
151,641 bp · 134 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 37910 75820 113731 151641 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN trnT-GGU psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG ycf1 rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2 rps19
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG trnS-GCU atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
135 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 12 85 74 Locate
psbA gene − 396 1454 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1686 4279 2594 Locate
matK gene − 1985 3547 1563 Locate
rps16 gene − 4845 5960 1116 Locate
trnQ-UUG gene − 6949 7020 72 Locate
psbK gene + 7400 7579 180 Locate
psbI gene + 7972 8082 111 Locate
trnS-GCU gene − 8232 8319 88 Locate
trnG-UCC gene + 9001 9755 755 Locate
trnR-UCU gene + 9938 10009 72 Locate
atpA gene − 10115 11638 1524 Locate
atpF gene − 11745 12997 1253 Locate
atpH gene − 13264 13509 246 Locate
atpI gene − 14512 15255 744 Locate
rps2 gene − 15480 16190 711 Locate
rpoC2 gene − 16399 20586 4188 Locate
rpoC1 gene − 20744 23564 2821 Locate
rpoB gene − 23591 26803 3213 Locate
trnC-GCA gene + 27953 28023 71 Locate
petN gene + 28187 28276 90 Locate
psbM gene − 29252 29356 105 Locate
trnD-GUC gene − 29875 29948 74 Locate
trnY-GUA gene − 30059 30142 84 Locate
trnE-UUC gene − 30208 30280 73 Locate
trnT-GGU gene + 30820 30891 72 Locate
psbD gene + 32268 33329 1062 Locate
psbC gene + 33277 34698 1422 Locate
trnS-UGA gene − 34944 35036 93 Locate
psbZ gene + 35371 35559 189 Locate
trnG-GCC gene + 35831 35901 71 Locate
trnfM-CAU gene − 36075 36148 74 Locate
rps14 gene − 36293 36595 303 Locate
psaB gene − 36718 38922 2205 Locate
psaA gene − 38948 41200 2253 Locate
ycf3 gene − 41990 43927 1938 Locate
trnS-GGA gene + 44745 44831 87 Locate
rps4 gene − 45108 45713 606 Locate
trnT-UGU gene − 46086 46158 73 Locate
trnL-UAA gene + 46824 47363 540 Locate
trnF-GAA gene + 47662 47734 73 Locate
ndhJ gene − 48268 48744 477 Locate
ndhK gene − 48855 49532 678 Locate
ndhC gene − 49584 49946 363 Locate
trnV-UAC gene − 50888 51536 649 Locate
trnM-CAU gene + 51717 51789 73 Locate
atpE gene − 51994 52395 402 Locate
atpB gene − 52392 53888 1497 Locate
rbcL gene + 54652 56106 1455 Locate
accD gene + 56803 58290 1488 Locate
psaI gene + 58765 58875 111 Locate
ycf4 gene + 59322 59876 555 Locate
cemA gene + 60487 61176 690 Locate
petA gene + 61397 62359 963 Locate
psbJ gene − 63412 63534 123 Locate
psbL gene − 63664 63780 117 Locate
psbF gene − 63804 63923 120 Locate
psbE gene − 63938 64189 252 Locate
petL gene + 64963 65058 96 Locate
petG gene + 65238 65351 114 Locate
trnW-CCA gene − 65466 65539 74 Locate
trnP-UGG gene − 65718 65791 74 Locate
psaJ gene + 66043 66216 174 Locate
rpl33 gene + 66667 66867 201 Locate
rps18 gene + 67033 67338 306 Locate
rpl20 gene − 67590 67976 387 Locate
rps12 gene − 68788 68901 114 Locate
clpP gene − 69025 70941 1917 Locate
psbB gene + 71390 72916 1527 Locate
psbT gene + 73095 73202 108 Locate
psbN gene − 73263 73394 132 Locate
psbH gene + 73500 73721 222 Locate
petB gene + 73855 75204 1350 Locate
petD gene + 75398 76594 1197 Locate
rpoA gene − 76771 77778 1008 Locate
rps11 gene − 77850 78266 417 Locate
rpl36 gene − 78376 78489 114 Locate
infA gene − 78585 78818 234 Locate
rps8 gene − 78945 79349 405 Locate
rpl14 gene − 79538 79906 369 Locate
rpl16 gene − 80038 81315 1278 Locate
rps3 gene − 81451 82113 663 Locate
rpl22 gene − 82098 82565 468 Locate
rps19 gene − 82635 82913 279 Locate
rpl2 gene − 82973 84455 1483 Locate
rpl23 gene − 84474 84755 282 Locate
trnI-CAU gene − 84921 84994 74 Locate
ycf2 gene + 85083 91928 6846 Locate
ycf15 gene + 92019 92267 249 Locate
trnL-CAA gene − 92528 92608 81 Locate
ndhB gene − 93168 95321 2154 Locate
rps7 gene − 95650 96117 468 Locate
rps12 gene − 96171 96954 784 Locate
trnV-GAC gene + 98581 98652 72 Locate
rrn16 gene + 98879 100369 1491 Locate
trnI-GAU gene + 100668 101680 1013 Locate
trnA-UGC gene + 101745 102626 882 Locate
rrn23 gene + 102792 105600 2809 Locate
rrn4.5 gene + 105701 105803 103 Locate
rrn5 gene + 106059 106179 121 Locate
trnR-ACG gene + 106423 106496 74 Locate
trnN-GUU gene − 107016 107087 72 Locate
ycf1 gene + 107306 108472 1167 Locate
ndhF gene − 108441 110675 2235 Locate
rpl32 gene + 111101 111271 171 Locate
trnL-UAG gene + 111973 112052 80 Locate
ccsA gene + 112097 113122 1026 Locate
ndhD gene − 113353 114894 1542 Locate
psaC gene − 114993 115238 246 Locate
ndhE gene − 115489 115791 303 Locate
ndhG gene − 116009 116539 531 Locate
ndhI gene − 116920 117426 507 Locate
ndhA gene − 117507 119590 2084 Locate
ndhH gene − 119592 120827 1236 Locate
rps15 gene − 120873 121145 273 Locate
ycf1 gene − 121562 127207 5646 Locate
trnN-GUU gene + 127426 127497 72 Locate
trnR-ACG gene − 128017 128090 74 Locate
rrn5 gene − 128334 128454 121 Locate
rrn4.5 gene − 128710 128812 103 Locate
rrn23 gene − 128913 131721 2809 Locate
trnA-UGC gene − 131887 132768 882 Locate
trnI-GAU gene − 132833 133845 1013 Locate
rrn16 gene − 134144 135634 1491 Locate
trnV-GAC gene − 135861 135932 72 Locate
rps12 gene + 137559 138342 784 Locate
rps7 gene + 138396 138863 468 Locate
ndhB gene + 139192 141345 2154 Locate
trnL-CAA gene + 141905 141985 81 Locate
ycf15 gene − 142246 142494 249 Locate
ycf2 gene − 142585 149430 6846 Locate
trnI-CAU gene + 149519 149592 74 Locate
rpl23 gene + 149758 150039 282 Locate
rpl2 gene + 150058 151540 1483 Locate
rps19 gene + 151600 151641 42 Locate
Status Available
Accession MW752208.1
Length 151,641 bp
GC content 38.0%
Annotated genes 134
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 15 Ribosomal Protein 27 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources