Scutellaria tournefortii chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
IR
IR
trnH-GUG · PQ059214.1 · 4–77 bp · −
psbA · PQ059214.1 · 378–1,436 bp · −
trnK-UUU · PQ059214.1 · 1,677–4,271 bp · −
matK · PQ059214.1 · 1,966–3,510 bp · −
rps16 · PQ059214.1 · 5,191–6,364 bp · −
trnQ-UUG · PQ059214.1 · 7,476–7,547 bp · −
trnS-GCU · PQ059214.1 · 8,662–8,749 bp · −
atpA · PQ059214.1 · 10,526–12,049 bp · −
atpF · PQ059214.1 · 12,130–13,357 bp · −
atpH · PQ059214.1 · 13,723–13,968 bp · −
atpI · PQ059214.1 · 14,962–15,705 bp · −
rps2 · PQ059214.1 · 16,053–16,889 bp · −
rpoC2 · PQ059214.1 · 16,984–21,183 bp · −
rpoC1 · PQ059214.1 · 21,338–24,168 bp · −
rpoB · PQ059214.1 · 24,195–27,407 bp · −
psbM · PQ059214.1 · 30,457–30,570 bp · −
trnD-GUC · PQ059214.1 · 31,096–31,169 bp · −
trnY-GUA · PQ059214.1 · 31,283–31,366 bp · −
trnE-UUC · PQ059214.1 · 31,426–31,498 bp · −
trnS-UGA · PQ059214.1 · 36,115–36,206 bp · −
trnfM-CAU · PQ059214.1 · 37,200–37,273 bp · −
rps14 · PQ059214.1 · 37,423–37,725 bp · −
psaB · PQ059214.1 · 37,857–40,061 bp · −
psaA · PQ059214.1 · 40,087–42,339 bp · −
ycf3 · PQ059214.1 · 43,036–44,958 bp · −
rps4 · PQ059214.1 · 46,205–46,810 bp · −
trnT-UGU · PQ059214.1 · 47,147–47,219 bp · −
ndhJ · PQ059214.1 · 49,466–49,942 bp · −
ndhK · PQ059214.1 · 50,051–50,728 bp · −
ndhC · PQ059214.1 · 50,781–51,143 bp · −
trnV-UAC · PQ059214.1 · 52,132–52,790 bp · −
atpE · PQ059214.1 · 53,252–53,653 bp · −
atpB · PQ059214.1 · 53,650–55,146 bp · −
psbJ · PQ059214.1 · 64,317–64,439 bp · −
psbL · PQ059214.1 · 64,573–64,689 bp · −
psbF · PQ059214.1 · 64,713–64,832 bp · −
psbE · PQ059214.1 · 64,847–65,098 bp · −
trnW-CCA · PQ059214.1 · 66,509–66,582 bp · −
trnP-UGG · PQ059214.1 · 66,752–66,825 bp · −
rpl20 · PQ059214.1 · 68,633–69,019 bp · −
rps12 · PQ059214.1 · 69,800–69,925 bp · −
rps12 · PQ059214.1 · 97,109–97,899 bp · −
clpP · PQ059214.1 · 70,065–72,000 bp · −
psbN · PQ059214.1 · 74,328–74,459 bp · −
rpoA · PQ059214.1 · 77,840–78,853 bp · −
rps11 · PQ059214.1 · 78,925–79,341 bp · −
rpl36 · PQ059214.1 · 79,443–79,556 bp · −
infA · PQ059214.1 · 79,652–79,885 bp · −
rps8 · PQ059214.1 · 80,008–80,418 bp · −
rpl14 · PQ059214.1 · 80,573–80,941 bp · −
rpl16 · PQ059214.1 · 81,068–82,298 bp · −
rps3 · PQ059214.1 · 82,453–83,115 bp · −
rpl22 · PQ059214.1 · 83,117–83,572 bp · −
rps19 · PQ059214.1 · 83,632–83,910 bp · −
rpl2 · PQ059214.1 · 83,966–85,448 bp · −
rpl23 · PQ059214.1 · 85,467–85,748 bp · −
trnI-CAU · PQ059214.1 · 85,908–85,981 bp · −
trnL-CAA · PQ059214.1 · 93,479–93,559 bp · −
ndhB · PQ059214.1 · 94,102–96,313 bp · −
rps7 · PQ059214.1 · 96,588–97,055 bp · −
trnN-GUU · PQ059214.1 · 107,940–108,011 bp · −
ndhF · PQ059214.1 · 109,088–111,328 bp · −
ndhD · PQ059214.1 · 113,853–115,382 bp · −
psaC · PQ059214.1 · 115,485–115,730 bp · −
ndhE · PQ059214.1 · 115,986–116,291 bp · −
ndhG · PQ059214.1 · 116,515–117,045 bp · −
ndhI · PQ059214.1 · 117,395–117,895 bp · −
ndhA · PQ059214.1 · 117,976–120,084 bp · −
ndhH · PQ059214.1 · 120,086–121,267 bp · −
rps15 · PQ059214.1 · 121,364–121,636 bp · −
ycf1 · PQ059214.1 · 121,903–127,563 bp · −
trnR-ACG · PQ059214.1 · 128,409–128,482 bp · −
rrn5 · PQ059214.1 · 128,717–128,837 bp · −
rrn4.5 · PQ059214.1 · 129,085–129,187 bp · −
rrn23 · PQ059214.1 · 129,286–132,097 bp · −
trnA-UGC · PQ059214.1 · 132,267–133,154 bp · −
trnI-GAU · PQ059214.1 · 133,219–134,238 bp · −
ycf68 · PQ059214.1 · 133,790–134,083 bp · −
rrn16 · PQ059214.1 · 134,537–136,027 bp · −
trnV-GAC · PQ059214.1 · 136,250–136,321 bp · −
ycf15 · PQ059214.1 · 142,575–142,772 bp · −
ycf2 · PQ059214.1 · 142,914–149,723 bp · −
psbK · PQ059214.1 · 7,872–8,057 bp · +
psbI · PQ059214.1 · 8,447–8,557 bp · +
trnG-UCC · PQ059214.1 · 9,438–10,192 bp · +
trnR-UCU · PQ059214.1 · 10,358–10,429 bp · +
trnC-GCA · PQ059214.1 · 28,574–28,644 bp · +
petN · PQ059214.1 · 29,381–29,470 bp · +
trnT-GGU · PQ059214.1 · 32,070–32,141 bp · +
psbD · PQ059214.1 · 33,450–34,511 bp · +
psbC · PQ059214.1 · 34,459–35,880 bp · +
psbZ · PQ059214.1 · 36,526–36,714 bp · +
trnG-GCC · PQ059214.1 · 36,986–37,056 bp · +
trnS-GGA · PQ059214.1 · 45,836–45,922 bp · +
trnL-UAA · PQ059214.1 · 47,895–48,461 bp · +
trnF-GAA · PQ059214.1 · 48,760–48,832 bp · +
trnM-CAU · PQ059214.1 · 52,971–53,043 bp · +
rbcL · PQ059214.1 · 55,893–57,356 bp · +
accD · PQ059214.1 · 58,073–59,563 bp · +
psaI · PQ059214.1 · 59,801–59,911 bp · +
ycf4 · PQ059214.1 · 60,345–60,899 bp · +
cemA · PQ059214.1 · 61,523–62,122 bp · +
petA · PQ059214.1 · 62,329–63,291 bp · +
petL · PQ059214.1 · 66,016–66,111 bp · +
petG · PQ059214.1 · 66,287–66,400 bp · +
psaJ · PQ059214.1 · 67,098–67,232 bp · +
rpl33 · PQ059214.1 · 67,713–67,913 bp · +
rps18 · PQ059214.1 · 68,087–68,392 bp · +
rps12 · PQ059214.1 · 137,894–138,684 bp · +
psbB · PQ059214.1 · 72,454–73,980 bp · +
psbT · PQ059214.1 · 74,160–74,267 bp · +
psbH · PQ059214.1 · 74,563–74,784 bp · +
petB · PQ059214.1 · 74,909–76,277 bp · +
petD · PQ059214.1 · 76,466–77,677 bp · +
ycf2 · PQ059214.1 · 86,070–92,879 bp · +
ycf15 · PQ059214.1 · 93,021–93,218 bp · +
trnV-GAC · PQ059214.1 · 99,472–99,543 bp · +
rrn16 · PQ059214.1 · 99,766–101,256 bp · +
trnI-GAU · PQ059214.1 · 101,555–102,574 bp · +
trnA-UGC · PQ059214.1 · 102,639–103,526 bp · +
rrn23 · PQ059214.1 · 103,696–106,507 bp · +
rrn4.5 · PQ059214.1 · 106,606–106,708 bp · +
rrn5 · PQ059214.1 · 106,956–107,076 bp · +
trnR-ACG · PQ059214.1 · 107,311–107,384 bp · +
rpl32 · PQ059214.1 · 111,828–112,004 bp · +
trnL-UAG · PQ059214.1 · 112,440–112,519 bp · +
ccsA · PQ059214.1 · 112,545–113,600 bp · +
trnN-GUU · PQ059214.1 · 127,782–127,853 bp · +
rps7 · PQ059214.1 · 138,738–139,205 bp · +
ndhB · PQ059214.1 · 139,480–141,691 bp · +
trnL-CAA · PQ059214.1 · 142,234–142,314 bp · +
trnI-CAU · PQ059214.1 · 149,812–149,885 bp · +
rpl23 · PQ059214.1 · 150,045–150,326 bp · +
rpl2 · PQ059214.1 · 150,345–151,827 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Scutellaria tournefortii
ANNOTATED PLASTOME
PQ059214.1
151,923 bp · 133 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 37981 75962 113942 151923 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN trnT-GGU psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG trnS-GCU atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU ycf68 rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
134 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 4 77 74 Locate
psbA gene − 378 1436 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1677 4271 2595 Locate
matK gene − 1966 3510 1545 Locate
rps16 gene − 5191 6364 1174 Locate
trnQ-UUG gene − 7476 7547 72 Locate
psbK gene + 7872 8057 186 Locate
psbI gene + 8447 8557 111 Locate
trnS-GCU gene − 8662 8749 88 Locate
trnG-UCC gene + 9438 10192 755 Locate
trnR-UCU gene + 10358 10429 72 Locate
atpA gene − 10526 12049 1524 Locate
atpF gene − 12130 13357 1228 Locate
atpH gene − 13723 13968 246 Locate
atpI gene − 14962 15705 744 Locate
rps2 gene − 16053 16889 837 Locate
rpoC2 gene − 16984 21183 4200 Locate
rpoC1 gene − 21338 24168 2831 Locate
rpoB gene − 24195 27407 3213 Locate
trnC-GCA gene + 28574 28644 71 Locate
petN gene + 29381 29470 90 Locate
psbM gene − 30457 30570 114 Locate
trnD-GUC gene − 31096 31169 74 Locate
trnY-GUA gene − 31283 31366 84 Locate
trnE-UUC gene − 31426 31498 73 Locate
trnT-GGU gene + 32070 32141 72 Locate
psbD gene + 33450 34511 1062 Locate
psbC gene + 34459 35880 1422 Locate
trnS-UGA gene − 36115 36206 92 Locate
psbZ gene + 36526 36714 189 Locate
trnG-GCC gene + 36986 37056 71 Locate
trnfM-CAU gene − 37200 37273 74 Locate
rps14 gene − 37423 37725 303 Locate
psaB gene − 37857 40061 2205 Locate
psaA gene − 40087 42339 2253 Locate
ycf3 gene − 43036 44958 1923 Locate
trnS-GGA gene + 45836 45922 87 Locate
rps4 gene − 46205 46810 606 Locate
trnT-UGU gene − 47147 47219 73 Locate
trnL-UAA gene + 47895 48461 567 Locate
trnF-GAA gene + 48760 48832 73 Locate
ndhJ gene − 49466 49942 477 Locate
ndhK gene − 50051 50728 678 Locate
ndhC gene − 50781 51143 363 Locate
trnV-UAC gene − 52132 52790 659 Locate
trnM-CAU gene + 52971 53043 73 Locate
atpE gene − 53252 53653 402 Locate
atpB gene − 53650 55146 1497 Locate
rbcL gene + 55893 57356 1464 Locate
accD gene + 58073 59563 1491 Locate
psaI gene + 59801 59911 111 Locate
ycf4 gene + 60345 60899 555 Locate
cemA gene + 61523 62122 600 Locate
petA gene + 62329 63291 963 Locate
psbJ gene − 64317 64439 123 Locate
psbL gene − 64573 64689 117 Locate
psbF gene − 64713 64832 120 Locate
psbE gene − 64847 65098 252 Locate
petL gene + 66016 66111 96 Locate
petG gene + 66287 66400 114 Locate
trnW-CCA gene − 66509 66582 74 Locate
trnP-UGG gene − 66752 66825 74 Locate
psaJ gene + 67098 67232 135 Locate
rpl33 gene + 67713 67913 201 Locate
rps18 gene + 68087 68392 306 Locate
rpl20 gene − 68633 69019 387 Locate
rps12 gene − 69800 69925 126 Locate
clpP gene − 70065 72000 1936 Locate
psbB gene + 72454 73980 1527 Locate
psbT gene + 74160 74267 108 Locate
psbN gene − 74328 74459 132 Locate
psbH gene + 74563 74784 222 Locate
petB gene + 74909 76277 1369 Locate
petD gene + 76466 77677 1212 Locate
rpoA gene − 77840 78853 1014 Locate
rps11 gene − 78925 79341 417 Locate
rpl36 gene − 79443 79556 114 Locate
infA gene − 79652 79885 234 Locate
rps8 gene − 80008 80418 411 Locate
rpl14 gene − 80573 80941 369 Locate
rpl16 gene − 81068 82298 1231 Locate
rps3 gene − 82453 83115 663 Locate
rpl22 gene − 83117 83572 456 Locate
rps19 gene − 83632 83910 279 Locate
rpl2 gene − 83966 85448 1483 Locate
rpl23 gene − 85467 85748 282 Locate
trnI-CAU gene − 85908 85981 74 Locate
ycf2 gene + 86070 92879 6810 Locate
ycf15 gene + 93021 93218 198 Locate
trnL-CAA gene − 93479 93559 81 Locate
ndhB gene − 94102 96313 2212 Locate
rps7 gene − 96588 97055 468 Locate
rps12 gene − 97109 97899 791 Locate
trnV-GAC gene + 99472 99543 72 Locate
rrn16 gene + 99766 101256 1491 Locate
trnI-GAU gene + 101555 102574 1020 Locate
trnA-UGC gene + 102639 103526 888 Locate
rrn23 gene + 103696 106507 2812 Locate
rrn4.5 gene + 106606 106708 103 Locate
rrn5 gene + 106956 107076 121 Locate
trnR-ACG gene + 107311 107384 74 Locate
trnN-GUU gene − 107940 108011 72 Locate
ndhF gene − 109088 111328 2241 Locate
rpl32 gene + 111828 112004 177 Locate
trnL-UAG gene + 112440 112519 80 Locate
ccsA gene + 112545 113600 1056 Locate
ndhD gene − 113853 115382 1530 Locate
psaC gene − 115485 115730 246 Locate
ndhE gene − 115986 116291 306 Locate
ndhG gene − 116515 117045 531 Locate
ndhI gene − 117395 117895 501 Locate
ndhA gene − 117976 120084 2109 Locate
ndhH gene − 120086 121267 1182 Locate
rps15 gene − 121364 121636 273 Locate
ycf1 gene − 121903 127563 5661 Locate
trnN-GUU gene + 127782 127853 72 Locate
trnR-ACG gene − 128409 128482 74 Locate
rrn5 gene − 128717 128837 121 Locate
rrn4.5 gene − 129085 129187 103 Locate
rrn23 gene − 129286 132097 2812 Locate
trnA-UGC gene − 132267 133154 888 Locate
trnI-GAU gene − 133219 134238 1020 Locate
ycf68 gene − 133790 134083 294 Locate
rrn16 gene − 134537 136027 1491 Locate
trnV-GAC gene − 136250 136321 72 Locate
rps12 gene + 137894 138684 791 Locate
rps7 gene + 138738 139205 468 Locate
ndhB gene + 139480 141691 2212 Locate
trnL-CAA gene + 142234 142314 81 Locate
ycf15 gene − 142575 142772 198 Locate
ycf2 gene − 142914 149723 6810 Locate
trnI-CAU gene + 149812 149885 74 Locate
rpl23 gene + 150045 150326 282 Locate
rpl2 gene + 150345 151827 1483 Locate
Status Available
Accession PQ059214.1
Length 151,923 bp
GC content 38.3%
Annotated genes 133
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 15 Ribosomal Protein 26 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources