Chaiturus marrubiastrum chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
IR
IR
trnH-GUG · PQ180372.1 · 1–73 bp · −
trnH-GUG · PQ180372.1 · 152,089–152,089 bp · −
psbA · PQ180372.1 · 305–1,363 bp · −
trnK-UUU · PQ180372.1 · 1,596–4,185 bp · −
matK · PQ180372.1 · 1,898–3,433 bp · −
rps16 · PQ180372.1 · 5,097–6,238 bp · −
trnQ-UUG · PQ180372.1 · 7,250–7,321 bp · −
atpA · PQ180372.1 · 10,332–11,855 bp · −
atpF · PQ180372.1 · 11,965–13,177 bp · −
atpH · PQ180372.1 · 13,541–13,786 bp · −
atpI · PQ180372.1 · 14,763–15,506 bp · −
rps2 · PQ180372.1 · 15,737–16,447 bp · −
rpoC2 · PQ180372.1 · 16,667–20,857 bp · −
rpoC1 · PQ180372.1 · 21,012–23,850 bp · −
rpoB · PQ180372.1 · 23,877–27,089 bp · −
psbM · PQ180372.1 · 29,971–30,075 bp · −
trnD-GUC · PQ180372.1 · 30,620–30,693 bp · −
trnY-GUA · PQ180372.1 · 30,808–30,891 bp · −
trnE-UUC · PQ180372.1 · 30,951–31,023 bp · −
trnT-CGU · PQ180372.1 · 31,610–31,681 bp · −
trnS-UGA · PQ180372.1 · 35,598–35,690 bp · −
trnfM-CAU · PQ180372.1 · 36,668–36,741 bp · −
rps14 · PQ180372.1 · 36,891–37,193 bp · −
psaB · PQ180372.1 · 37,321–39,525 bp · −
psaA · PQ180372.1 · 39,551–41,803 bp · −
ycf3 · PQ180372.1 · 42,529–44,472 bp · −
rps4 · PQ180372.1 · 45,160–45,765 bp · −
trnT-UGU · PQ180372.1 · 46,169–46,241 bp · −
ndhJ · PQ180372.1 · 48,535–49,029 bp · −
ndhK · PQ180372.1 · 49,112–49,789 bp · −
ndhC · PQ180372.1 · 49,843–50,205 bp · −
trnV-UAC · PQ180372.1 · 50,892–51,550 bp · −
atpE · PQ180372.1 · 52,029–52,430 bp · −
atpB · PQ180372.1 · 52,427–53,923 bp · −
psbJ · PQ180372.1 · 63,610–63,732 bp · −
psbL · PQ180372.1 · 63,870–63,986 bp · −
psbF · PQ180372.1 · 64,010–64,129 bp · −
psbE · PQ180372.1 · 64,144–64,395 bp · −
trnW-CCA · PQ180372.1 · 65,833–65,906 bp · −
trnP-UGG · PQ180372.1 · 66,070–66,143 bp · −
rpl20 · PQ180372.1 · 67,896–68,282 bp · −
rps12 · PQ180372.1 · 69,038–69,151 bp · −
rps12 · PQ180372.1 · 96,419–97,213 bp · −
clpP · PQ180372.1 · 69,277–71,151 bp · −
psbN · PQ180372.1 · 73,469–73,600 bp · −
rpoA · PQ180372.1 · 77,012–78,025 bp · −
rps11 · PQ180372.1 · 78,097–78,528 bp · −
rpl36 · PQ180372.1 · 78,616–78,729 bp · −
infA · PQ180372.1 · 78,825–79,058 bp · −
rps8 · PQ180372.1 · 79,182–79,595 bp · −
rpl14 · PQ180372.1 · 79,768–80,136 bp · −
rpl16 · PQ180372.1 · 80,263–81,557 bp · −
rps3 · PQ180372.1 · 81,704–82,366 bp · −
rpl22 · PQ180372.1 · 82,351–82,815 bp · −
rps19 · PQ180372.1 · 82,875–83,150 bp · −
rpl2 · PQ180372.1 · 83,259–84,750 bp · −
rpl23 · PQ180372.1 · 84,769–85,050 bp · −
trnI-CAU · PQ180372.1 · 85,216–85,289 bp · −
trnL-CAA · PQ180372.1 · 92,787–92,867 bp · −
ndhB · PQ180372.1 · 93,412–95,623 bp · −
rps7 · PQ180372.1 · 95,898–96,365 bp · −
trnN-GUU · PQ180372.1 · 107,317–107,388 bp · −
ndhF · PQ180372.1 · 108,778–111,000 bp · −
ndhD · PQ180372.1 · 113,734–115,254 bp · −
psaC · PQ180372.1 · 115,362–115,607 bp · −
ndhE · PQ180372.1 · 115,870–116,175 bp · −
ndhG · PQ180372.1 · 116,392–116,922 bp · −
ndhI · PQ180372.1 · 117,300–117,806 bp · −
ndhA · PQ180372.1 · 117,893–120,060 bp · −
ndhH · PQ180372.1 · 120,062–121,243 bp · −
rps15 · PQ180372.1 · 121,344–121,616 bp · −
ycf1 · PQ180372.1 · 122,003–127,537 bp · −
trnR-ACG · PQ180372.1 · 128,504–128,582 bp · −
rrn5 · PQ180372.1 · 128,812–128,932 bp · −
rrn4.5 · PQ180372.1 · 129,188–129,290 bp · −
rrn23 · PQ180372.1 · 129,389–132,199 bp · −
trnA-UGC · PQ180372.1 · 132,391–133,269 bp · −
trnI-GAU · PQ180372.1 · 133,334–134,342 bp · −
rrn16 · PQ180372.1 · 134,632–136,122 bp · −
trnV-GAC · PQ180372.1 · 136,350–136,421 bp · −
ycf15 · PQ180372.1 · 142,716–142,964 bp · −
ycf2 · PQ180372.1 · 143,007–149,873 bp · −
psbK · PQ180372.1 · 7,658–7,843 bp · +
psbI · PQ180372.1 · 8,221–8,331 bp · +
trnG-UCC · PQ180372.1 · 9,228–9,987 bp · +
trnR-UCU · PQ180372.1 · 10,161–10,235 bp · +
trnC-GCA · PQ180372.1 · 28,191–28,266 bp · +
petN · PQ180372.1 · 29,097–29,186 bp · +
psbD · PQ180372.1 · 32,935–33,996 bp · +
psbC · PQ180372.1 · 33,944–35,365 bp · +
psbZ · PQ180372.1 · 36,017–36,205 bp · +
trnG-GCC · PQ180372.1 · 36,437–36,507 bp · +
trnS-GGA · PQ180372.1 · 44,789–44,875 bp · +
trnL-UAA · PQ180372.1 · 46,928–47,501 bp · +
trnF-GAA · PQ180372.1 · 47,793–47,865 bp · +
trnM-CAU · PQ180372.1 · 51,739–51,811 bp · +
rbcL · PQ180372.1 · 54,715–56,181 bp · +
accD · PQ180372.1 · 56,871–58,337 bp · +
psaI · PQ180372.1 · 59,021–59,131 bp · +
ycf4 · PQ180372.1 · 59,581–60,135 bp · +
cemA · PQ180372.1 · 60,696–61,385 bp · +
petA · PQ180372.1 · 61,602–62,564 bp · +
petL · PQ180372.1 · 65,324–65,419 bp · +
petG · PQ180372.1 · 65,594–65,707 bp · +
psaJ · PQ180372.1 · 66,418–66,552 bp · +
rpl33 · PQ180372.1 · 67,026–67,226 bp · +
rps18 · PQ180372.1 · 67,374–67,679 bp · +
rps12 · PQ180372.1 · 138,038–138,832 bp · +
psbB · PQ180372.1 · 71,582–73,108 bp · +
psbT · PQ180372.1 · 73,301–73,408 bp · +
psbH · PQ180372.1 · 73,704–73,925 bp · +
petB · PQ180372.1 · 74,050–75,435 bp · +
petD · PQ180372.1 · 75,630–76,843 bp · +
ycf2 · PQ180372.1 · 85,378–92,244 bp · +
ycf15 · PQ180372.1 · 92,287–92,535 bp · +
trnV-GAC · PQ180372.1 · 98,830–98,901 bp · +
rrn16 · PQ180372.1 · 99,129–100,619 bp · +
trnI-GAU · PQ180372.1 · 100,909–101,917 bp · +
trnA-UGC · PQ180372.1 · 101,982–102,860 bp · +
rrn23 · PQ180372.1 · 103,052–105,862 bp · +
rrn4.5 · PQ180372.1 · 105,961–106,063 bp · +
rrn5 · PQ180372.1 · 106,319–106,439 bp · +
trnR-ACG · PQ180372.1 · 106,669–106,747 bp · +
rpl32 · PQ180372.1 · 111,507–111,683 bp · +
trnL-UAG · PQ180372.1 · 112,411–112,490 bp · +
ccsA · PQ180372.1 · 112,581–113,552 bp · +
trnN-GUU · PQ180372.1 · 127,863–127,934 bp · +
rps7 · PQ180372.1 · 138,886–139,353 bp · +
ndhB · PQ180372.1 · 139,628–141,839 bp · +
trnL-CAA · PQ180372.1 · 142,384–142,464 bp · +
trnI-CAU · PQ180372.1 · 149,962–150,035 bp · +
rpl23 · PQ180372.1 · 150,201–150,482 bp · +
rpl2 · PQ180372.1 · 150,501–151,992 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Chaiturus marrubiastrum
ANNOTATED PLASTOME
PQ180372.1
152,089 bp · 131 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 38022 76044 114067 152089 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnT-CGU trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2 trnH-GUG
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
133 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 1 73 73 Locate
psbA gene − 305 1363 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1596 4185 2590 Locate
matK gene − 1898 3433 1536 Locate
rps16 gene − 5097 6238 1142 Locate
trnQ-UUG gene − 7250 7321 72 Locate
psbK gene + 7658 7843 186 Locate
psbI gene + 8221 8331 111 Locate
trnG-UCC gene + 9228 9987 760 Locate
trnR-UCU gene + 10161 10235 75 Locate
atpA gene − 10332 11855 1524 Locate
atpF gene − 11965 13177 1213 Locate
atpH gene − 13541 13786 246 Locate
atpI gene − 14763 15506 744 Locate
rps2 gene − 15737 16447 711 Locate
rpoC2 gene − 16667 20857 4191 Locate
rpoC1 gene − 21012 23850 2839 Locate
rpoB gene − 23877 27089 3213 Locate
trnC-GCA gene + 28191 28266 76 Locate
petN gene + 29097 29186 90 Locate
psbM gene − 29971 30075 105 Locate
trnD-GUC gene − 30620 30693 74 Locate
trnY-GUA gene − 30808 30891 84 Locate
trnE-UUC gene − 30951 31023 73 Locate
trnT-CGU gene − 31610 31681 72 Locate
psbD gene + 32935 33996 1062 Locate
psbC gene + 33944 35365 1422 Locate
trnS-UGA gene − 35598 35690 93 Locate
psbZ gene + 36017 36205 189 Locate
trnG-GCC gene + 36437 36507 71 Locate
trnfM-CAU gene − 36668 36741 74 Locate
rps14 gene − 36891 37193 303 Locate
psaB gene − 37321 39525 2205 Locate
psaA gene − 39551 41803 2253 Locate
ycf3 gene − 42529 44472 1944 Locate
trnS-GGA gene + 44789 44875 87 Locate
rps4 gene − 45160 45765 606 Locate
trnT-UGU gene − 46169 46241 73 Locate
trnL-UAA gene + 46928 47501 574 Locate
trnF-GAA gene + 47793 47865 73 Locate
ndhJ gene − 48535 49029 495 Locate
ndhK gene − 49112 49789 678 Locate
ndhC gene − 49843 50205 363 Locate
trnV-UAC gene − 50892 51550 659 Locate
trnM-CAU gene + 51739 51811 73 Locate
atpE gene − 52029 52430 402 Locate
atpB gene − 52427 53923 1497 Locate
rbcL gene + 54715 56181 1467 Locate
accD gene + 56871 58337 1467 Locate
psaI gene + 59021 59131 111 Locate
ycf4 gene + 59581 60135 555 Locate
cemA gene + 60696 61385 690 Locate
petA gene + 61602 62564 963 Locate
psbJ gene − 63610 63732 123 Locate
psbL gene − 63870 63986 117 Locate
psbF gene − 64010 64129 120 Locate
psbE gene − 64144 64395 252 Locate
petL gene + 65324 65419 96 Locate
petG gene + 65594 65707 114 Locate
trnW-CCA gene − 65833 65906 74 Locate
trnP-UGG gene − 66070 66143 74 Locate
psaJ gene + 66418 66552 135 Locate
rpl33 gene + 67026 67226 201 Locate
rps18 gene + 67374 67679 306 Locate
rpl20 gene − 67896 68282 387 Locate
rps12 gene − 69038 69151 114 Locate
clpP gene − 69277 71151 1875 Locate
psbB gene + 71582 73108 1527 Locate
psbT gene + 73301 73408 108 Locate
psbN gene − 73469 73600 132 Locate
psbH gene + 73704 73925 222 Locate
petB gene + 74050 75435 1386 Locate
petD gene + 75630 76843 1214 Locate
rpoA gene − 77012 78025 1014 Locate
rps11 gene − 78097 78528 432 Locate
rpl36 gene − 78616 78729 114 Locate
infA gene − 78825 79058 234 Locate
rps8 gene − 79182 79595 414 Locate
rpl14 gene − 79768 80136 369 Locate
rpl16 gene − 80263 81557 1295 Locate
rps3 gene − 81704 82366 663 Locate
rpl22 gene − 82351 82815 465 Locate
rps19 gene − 82875 83150 276 Locate
rpl2 gene − 83259 84750 1492 Locate
rpl23 gene − 84769 85050 282 Locate
trnI-CAU gene − 85216 85289 74 Locate
ycf2 gene + 85378 92244 6867 Locate
ycf15 gene + 92287 92535 249 Locate
trnL-CAA gene − 92787 92867 81 Locate
ndhB gene − 93412 95623 2212 Locate
rps7 gene − 95898 96365 468 Locate
rps12 gene − 96419 97213 795 Locate
trnV-GAC gene + 98830 98901 72 Locate
rrn16 gene + 99129 100619 1491 Locate
trnI-GAU gene + 100909 101917 1009 Locate
trnA-UGC gene + 101982 102860 879 Locate
rrn23 gene + 103052 105862 2811 Locate
rrn4.5 gene + 105961 106063 103 Locate
rrn5 gene + 106319 106439 121 Locate
trnR-ACG gene + 106669 106747 79 Locate
trnN-GUU gene − 107317 107388 72 Locate
ndhF gene − 108778 111000 2223 Locate
rpl32 gene + 111507 111683 177 Locate
trnL-UAG gene + 112411 112490 80 Locate
ccsA gene + 112581 113552 972 Locate
ndhD gene − 113734 115254 1521 Locate
psaC gene − 115362 115607 246 Locate
ndhE gene − 115870 116175 306 Locate
ndhG gene − 116392 116922 531 Locate
ndhI gene − 117300 117806 507 Locate
ndhA gene − 117893 120060 2168 Locate
ndhH gene − 120062 121243 1182 Locate
rps15 gene − 121344 121616 273 Locate
ycf1 gene − 122003 127537 5535 Locate
trnN-GUU gene + 127863 127934 72 Locate
trnR-ACG gene − 128504 128582 79 Locate
rrn5 gene − 128812 128932 121 Locate
rrn4.5 gene − 129188 129290 103 Locate
rrn23 gene − 129389 132199 2811 Locate
trnA-UGC gene − 132391 133269 879 Locate
trnI-GAU gene − 133334 134342 1009 Locate
rrn16 gene − 134632 136122 1491 Locate
trnV-GAC gene − 136350 136421 72 Locate
rps12 gene + 138038 138832 795 Locate
rps7 gene + 138886 139353 468 Locate
ndhB gene + 139628 141839 2212 Locate
trnL-CAA gene + 142384 142464 81 Locate
ycf15 gene − 142716 142964 249 Locate
ycf2 gene − 143007 149873 6867 Locate
trnI-CAU gene + 149962 150035 74 Locate
rpl23 gene + 150201 150482 282 Locate
rpl2 gene + 150501 151992 1492 Locate
trnH-GUG gene − 152089 152089 1 Locate
Status Available
Accession PQ180372.1
Length 152,089 bp
GC content 38.4%
Annotated genes 131
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 14 Ribosomal Protein 26 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources