Lagochilus bungei chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
IR
IR
trnH-GUG · PQ180373.1 · 2–75 bp · −
psbA · PQ180373.1 · 334–1,392 bp · −
trnK-UUU · PQ180373.1 · 1,625–4,212 bp · −
matK · PQ180373.1 · 1,926–3,461 bp · −
rps16 · PQ180373.1 · 4,941–6,084 bp · −
trnQ-UUG · PQ180373.1 · 7,098–7,169 bp · −
trnS-GGA · PQ180373.1 · 8,305–8,392 bp · −
atpA · PQ180373.1 · 10,165–11,688 bp · −
atpF · PQ180373.1 · 11,777–12,992 bp · −
atpH · PQ180373.1 · 13,352–13,597 bp · −
atpI · PQ180373.1 · 14,559–15,302 bp · −
rps2 · PQ180373.1 · 15,533–16,243 bp · −
rpoC2 · PQ180373.1 · 16,565–20,647 bp · −
rpoC1 · PQ180373.1 · 20,802–23,627 bp · −
rpoB · PQ180373.1 · 23,654–26,872 bp · −
psbM · PQ180373.1 · 29,733–29,837 bp · −
trnD-GUC · PQ180373.1 · 30,374–30,447 bp · −
trnY-GUA · PQ180373.1 · 30,561–30,644 bp · −
trnE-UUC · PQ180373.1 · 30,704–30,776 bp · −
trnT-CGU · PQ180373.1 · 31,375–31,446 bp · −
trnS-UGA · PQ180373.1 · 35,362–35,454 bp · −
trnfM-CAU · PQ180373.1 · 36,418–36,491 bp · −
rps14 · PQ180373.1 · 36,641–36,943 bp · −
psaB · PQ180373.1 · 37,072–39,276 bp · −
psaA · PQ180373.1 · 39,302–41,554 bp · −
ycf3 · PQ180373.1 · 42,138–44,078 bp · −
rps4 · PQ180373.1 · 44,760–45,365 bp · −
trnT-UGU · PQ180373.1 · 45,761–45,833 bp · −
ndhJ · PQ180373.1 · 48,117–48,611 bp · −
ndhK · PQ180373.1 · 48,694–49,371 bp · −
ndhC · PQ180373.1 · 49,425–49,787 bp · −
trnV-UAC · PQ180373.1 · 50,750–51,402 bp · −
atpE · PQ180373.1 · 51,881–52,282 bp · −
atpB · PQ180373.1 · 52,279–53,775 bp · −
psbJ · PQ180373.1 · 63,127–63,249 bp · −
psbL · PQ180373.1 · 63,387–63,503 bp · −
psbF · PQ180373.1 · 63,527–63,646 bp · −
psbE · PQ180373.1 · 63,661–63,912 bp · −
trnW-CCA · PQ180373.1 · 65,372–65,445 bp · −
trnP-UGG · PQ180373.1 · 65,613–65,686 bp · −
rpl20 · PQ180373.1 · 67,442–67,828 bp · −
rps12 · PQ180373.1 · 68,587–68,700 bp · −
rps12 · PQ180373.1 · 95,936–96,729 bp · −
clpP · PQ180373.1 · 68,826–70,700 bp · −
psbN · PQ180373.1 · 73,017–73,148 bp · −
rpoA · PQ180373.1 · 76,576–77,589 bp · −
rps11 · PQ180373.1 · 77,661–78,092 bp · −
rpl36 · PQ180373.1 · 78,180–78,293 bp · −
infA · PQ180373.1 · 78,389–78,622 bp · −
rps8 · PQ180373.1 · 78,744–79,157 bp · −
rpl14 · PQ180373.1 · 79,330–79,698 bp · −
rpl16 · PQ180373.1 · 79,825–81,117 bp · −
rps3 · PQ180373.1 · 81,264–81,926 bp · −
rpl22 · PQ180373.1 · 81,911–82,384 bp · −
rps19 · PQ180373.1 · 82,444–82,722 bp · −
rpl2 · PQ180373.1 · 82,774–84,265 bp · −
rpl23 · PQ180373.1 · 84,284–84,565 bp · −
trnI-CAU · PQ180373.1 · 84,731–84,804 bp · −
trnL-CAA · PQ180373.1 · 92,308–92,388 bp · −
ndhB · PQ180373.1 · 92,933–95,140 bp · −
rps7 · PQ180373.1 · 95,415–95,882 bp · −
trnN-GUU · PQ180373.1 · 106,846–106,917 bp · −
ndhF · PQ180373.1 · 108,307–110,529 bp · −
ndhD · PQ180373.1 · 113,257–114,783 bp · −
psaC · PQ180373.1 · 114,884–115,129 bp · −
ndhE · PQ180373.1 · 115,389–115,694 bp · −
ndhG · PQ180373.1 · 115,918–116,448 bp · −
ndhI · PQ180373.1 · 116,813–117,319 bp · −
ndhA · PQ180373.1 · 117,406–119,560 bp · −
ndhH · PQ180373.1 · 119,562–120,743 bp · −
rps15 · PQ180373.1 · 120,844–121,116 bp · −
ycf1 · PQ180373.1 · 121,542–127,058 bp · −
trnR-ACG · PQ180373.1 · 128,029–128,107 bp · −
rrn5 · PQ180373.1 · 128,337–128,457 bp · −
rrn4.5 · PQ180373.1 · 128,713–128,815 bp · −
rrn23 · PQ180373.1 · 128,914–131,724 bp · −
trnA-UGC · PQ180373.1 · 131,916–132,794 bp · −
trnI-GAU · PQ180373.1 · 132,859–133,874 bp · −
rrn16 · PQ180373.1 · 134,164–135,654 bp · −
trnV-GAC · PQ180373.1 · 135,882–135,953 bp · −
ycf15 · PQ180373.1 · 142,254–142,502 bp · −
ycf2 · PQ180373.1 · 142,542–149,408 bp · −
psbK · PQ180373.1 · 7,506–7,691 bp · +
psbI · PQ180373.1 · 8,067–8,177 bp · +
trnG-UCC · PQ180373.1 · 9,061–9,820 bp · +
trnR-UCU · PQ180373.1 · 9,994–10,068 bp · +
trnC-GCA · PQ180373.1 · 27,960–28,035 bp · +
petN · PQ180373.1 · 28,860–28,949 bp · +
psbD · PQ180373.1 · 32,701–33,762 bp · +
psbC · PQ180373.1 · 33,710–35,131 bp · +
psbZ · PQ180373.1 · 35,783–35,971 bp · +
trnG-GCC · PQ180373.1 · 36,203–36,273 bp · +
trnS-GGA · PQ180373.1 · 44,389–44,475 bp · +
trnL-UAA · PQ180373.1 · 46,509–47,088 bp · +
trnF-GAA · PQ180373.1 · 47,381–47,453 bp · +
trnM-CAU · PQ180373.1 · 51,591–51,663 bp · +
rbcL · PQ180373.1 · 54,568–56,034 bp · +
accD · PQ180373.1 · 56,741–58,207 bp · +
psaI · PQ180373.1 · 58,559–58,669 bp · +
ycf4 · PQ180373.1 · 59,099–59,653 bp · +
cemA · PQ180373.1 · 60,214–60,903 bp · +
petA · PQ180373.1 · 61,120–62,082 bp · +
petL · PQ180373.1 · 64,855–64,950 bp · +
petG · PQ180373.1 · 65,125–65,238 bp · +
psaJ · PQ180373.1 · 65,961–66,095 bp · +
rpl33 · PQ180373.1 · 66,567–66,767 bp · +
rps18 · PQ180373.1 · 66,925–67,230 bp · +
rps12 · PQ180373.1 · 137,572–138,365 bp · +
psbB · PQ180373.1 · 71,131–72,657 bp · +
psbT · PQ180373.1 · 72,849–72,956 bp · +
psbH · PQ180373.1 · 73,252–73,473 bp · +
petB · PQ180373.1 · 73,594–74,979 bp · +
petD · PQ180373.1 · 75,174–76,407 bp · +
ycf2 · PQ180373.1 · 84,893–91,759 bp · +
ycf15 · PQ180373.1 · 91,799–92,047 bp · +
trnV-GAC · PQ180373.1 · 98,348–98,419 bp · +
rrn16 · PQ180373.1 · 98,647–100,137 bp · +
trnI-GAU · PQ180373.1 · 100,427–101,442 bp · +
trnA-UGC · PQ180373.1 · 101,507–102,385 bp · +
rrn23 · PQ180373.1 · 102,577–105,387 bp · +
rrn4.5 · PQ180373.1 · 105,486–105,588 bp · +
rrn5 · PQ180373.1 · 105,844–105,964 bp · +
trnR-ACG · PQ180373.1 · 106,194–106,272 bp · +
rpl32 · PQ180373.1 · 111,034–111,210 bp · +
trnL-UAG · PQ180373.1 · 111,932–112,011 bp · +
ccsA · PQ180373.1 · 112,115–113,086 bp · +
trnN-GUU · PQ180373.1 · 127,384–127,455 bp · +
rps7 · PQ180373.1 · 138,419–138,886 bp · +
ndhB · PQ180373.1 · 139,161–141,368 bp · +
trnL-CAA · PQ180373.1 · 141,913–141,993 bp · +
trnI-CAU · PQ180373.1 · 149,497–149,570 bp · +
rpl23 · PQ180373.1 · 149,736–150,017 bp · +
rpl2 · PQ180373.1 · 150,036–151,527 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Lagochilus bungei
ANNOTATED PLASTOME
PQ180373.1
151,620 bp · 132 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 37905 75810 113715 151620 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG trnS-GGA atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnT-CGU trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
133 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 2 75 74 Locate
psbA gene − 334 1392 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1625 4212 2588 Locate
matK gene − 1926 3461 1536 Locate
rps16 gene − 4941 6084 1144 Locate
trnQ-UUG gene − 7098 7169 72 Locate
psbK gene + 7506 7691 186 Locate
psbI gene + 8067 8177 111 Locate
trnS-GGA gene − 8305 8392 88 Locate
trnG-UCC gene + 9061 9820 760 Locate
trnR-UCU gene + 9994 10068 75 Locate
atpA gene − 10165 11688 1524 Locate
atpF gene − 11777 12992 1216 Locate
atpH gene − 13352 13597 246 Locate
atpI gene − 14559 15302 744 Locate
rps2 gene − 15533 16243 711 Locate
rpoC2 gene − 16565 20647 4083 Locate
rpoC1 gene − 20802 23627 2826 Locate
rpoB gene − 23654 26872 3219 Locate
trnC-GCA gene + 27960 28035 76 Locate
petN gene + 28860 28949 90 Locate
psbM gene − 29733 29837 105 Locate
trnD-GUC gene − 30374 30447 74 Locate
trnY-GUA gene − 30561 30644 84 Locate
trnE-UUC gene − 30704 30776 73 Locate
trnT-CGU gene − 31375 31446 72 Locate
psbD gene + 32701 33762 1062 Locate
psbC gene + 33710 35131 1422 Locate
trnS-UGA gene − 35362 35454 93 Locate
psbZ gene + 35783 35971 189 Locate
trnG-GCC gene + 36203 36273 71 Locate
trnfM-CAU gene − 36418 36491 74 Locate
rps14 gene − 36641 36943 303 Locate
psaB gene − 37072 39276 2205 Locate
psaA gene − 39302 41554 2253 Locate
ycf3 gene − 42138 44078 1941 Locate
trnS-GGA gene + 44389 44475 87 Locate
rps4 gene − 44760 45365 606 Locate
trnT-UGU gene − 45761 45833 73 Locate
trnL-UAA gene + 46509 47088 580 Locate
trnF-GAA gene + 47381 47453 73 Locate
ndhJ gene − 48117 48611 495 Locate
ndhK gene − 48694 49371 678 Locate
ndhC gene − 49425 49787 363 Locate
trnV-UAC gene − 50750 51402 653 Locate
trnM-CAU gene + 51591 51663 73 Locate
atpE gene − 51881 52282 402 Locate
atpB gene − 52279 53775 1497 Locate
rbcL gene + 54568 56034 1467 Locate
accD gene + 56741 58207 1467 Locate
psaI gene + 58559 58669 111 Locate
ycf4 gene + 59099 59653 555 Locate
cemA gene + 60214 60903 690 Locate
petA gene + 61120 62082 963 Locate
psbJ gene − 63127 63249 123 Locate
psbL gene − 63387 63503 117 Locate
psbF gene − 63527 63646 120 Locate
psbE gene − 63661 63912 252 Locate
petL gene + 64855 64950 96 Locate
petG gene + 65125 65238 114 Locate
trnW-CCA gene − 65372 65445 74 Locate
trnP-UGG gene − 65613 65686 74 Locate
psaJ gene + 65961 66095 135 Locate
rpl33 gene + 66567 66767 201 Locate
rps18 gene + 66925 67230 306 Locate
rpl20 gene − 67442 67828 387 Locate
rps12 gene − 68587 68700 114 Locate
clpP gene − 68826 70700 1875 Locate
psbB gene + 71131 72657 1527 Locate
psbT gene + 72849 72956 108 Locate
psbN gene − 73017 73148 132 Locate
psbH gene + 73252 73473 222 Locate
petB gene + 73594 74979 1386 Locate
petD gene + 75174 76407 1234 Locate
rpoA gene − 76576 77589 1014 Locate
rps11 gene − 77661 78092 432 Locate
rpl36 gene − 78180 78293 114 Locate
infA gene − 78389 78622 234 Locate
rps8 gene − 78744 79157 414 Locate
rpl14 gene − 79330 79698 369 Locate
rpl16 gene − 79825 81117 1293 Locate
rps3 gene − 81264 81926 663 Locate
rpl22 gene − 81911 82384 474 Locate
rps19 gene − 82444 82722 279 Locate
rpl2 gene − 82774 84265 1492 Locate
rpl23 gene − 84284 84565 282 Locate
trnI-CAU gene − 84731 84804 74 Locate
ycf2 gene + 84893 91759 6867 Locate
ycf15 gene + 91799 92047 249 Locate
trnL-CAA gene − 92308 92388 81 Locate
ndhB gene − 92933 95140 2208 Locate
rps7 gene − 95415 95882 468 Locate
rps12 gene − 95936 96729 794 Locate
trnV-GAC gene + 98348 98419 72 Locate
rrn16 gene + 98647 100137 1491 Locate
trnI-GAU gene + 100427 101442 1016 Locate
trnA-UGC gene + 101507 102385 879 Locate
rrn23 gene + 102577 105387 2811 Locate
rrn4.5 gene + 105486 105588 103 Locate
rrn5 gene + 105844 105964 121 Locate
trnR-ACG gene + 106194 106272 79 Locate
trnN-GUU gene − 106846 106917 72 Locate
ndhF gene − 108307 110529 2223 Locate
rpl32 gene + 111034 111210 177 Locate
trnL-UAG gene + 111932 112011 80 Locate
ccsA gene + 112115 113086 972 Locate
ndhD gene − 113257 114783 1527 Locate
psaC gene − 114884 115129 246 Locate
ndhE gene − 115389 115694 306 Locate
ndhG gene − 115918 116448 531 Locate
ndhI gene − 116813 117319 507 Locate
ndhA gene − 117406 119560 2155 Locate
ndhH gene − 119562 120743 1182 Locate
rps15 gene − 120844 121116 273 Locate
ycf1 gene − 121542 127058 5517 Locate
trnN-GUU gene + 127384 127455 72 Locate
trnR-ACG gene − 128029 128107 79 Locate
rrn5 gene − 128337 128457 121 Locate
rrn4.5 gene − 128713 128815 103 Locate
rrn23 gene − 128914 131724 2811 Locate
trnA-UGC gene − 131916 132794 879 Locate
trnI-GAU gene − 132859 133874 1016 Locate
rrn16 gene − 134164 135654 1491 Locate
trnV-GAC gene − 135882 135953 72 Locate
rps12 gene + 137572 138365 794 Locate
rps7 gene + 138419 138886 468 Locate
ndhB gene + 139161 141368 2208 Locate
trnL-CAA gene + 141913 141993 81 Locate
ycf15 gene − 142254 142502 249 Locate
ycf2 gene − 142542 149408 6867 Locate
trnI-CAU gene + 149497 149570 74 Locate
rpl23 gene + 149736 150017 282 Locate
rpl2 gene + 150036 151527 1492 Locate
Status Available
Accession PQ180373.1
Length 151,620 bp
GC content 38.5%
Annotated genes 132
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 14 Ribosomal Protein 26 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources