Panzerina lanata chloroplast
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
IR
IR
trnH-GUG · PQ279582.1 · 2–75 bp · −
psbA · PQ279582.1 · 308–1,366 bp · −
trnK-UUU · PQ279582.1 · 1,599–4,186 bp · −
matK · PQ279582.1 · 1,901–3,436 bp · −
rps16 · PQ279582.1 · 5,090–6,234 bp · −
trnQ-UUG · PQ279582.1 · 6,911–6,982 bp · −
trnS-GGA · PQ279582.1 · 8,125–8,212 bp · −
atpA · PQ279582.1 · 9,998–11,521 bp · −
atpF · PQ279582.1 · 11,609–12,818 bp · −
atpH · PQ279582.1 · 13,183–13,428 bp · −
atpI · PQ279582.1 · 14,362–15,105 bp · −
rps2 · PQ279582.1 · 15,336–16,046 bp · −
rpoC2 · PQ279582.1 · 16,266–20,456 bp · −
rpoC1 · PQ279582.1 · 20,611–23,443 bp · −
rpoB · PQ279582.1 · 23,470–26,682 bp · −
psbM · PQ279582.1 · 29,587–29,691 bp · −
trnD-GUC · PQ279582.1 · 30,221–30,294 bp · −
trnY-GUA · PQ279582.1 · 30,410–30,493 bp · −
trnE-UUC · PQ279582.1 · 30,553–30,625 bp · −
trnT-CGU · PQ279582.1 · 31,192–31,263 bp · −
trnS-UGA · PQ279582.1 · 35,070–35,162 bp · −
trnfM-CAU · PQ279582.1 · 36,123–36,196 bp · −
rps14 · PQ279582.1 · 36,346–36,648 bp · −
psaB · PQ279582.1 · 36,776–38,980 bp · −
psaA · PQ279582.1 · 39,006–41,258 bp · −
ycf3 · PQ279582.1 · 41,986–43,919 bp · −
rps4 · PQ279582.1 · 44,607–45,212 bp · −
trnT-UGU · PQ279582.1 · 45,598–45,670 bp · −
ndhJ · PQ279582.1 · 47,957–48,451 bp · −
ndhK · PQ279582.1 · 48,534–49,211 bp · −
ndhC · PQ279582.1 · 49,264–49,626 bp · −
trnV-UAC · PQ279582.1 · 50,588–51,240 bp · −
atpE · PQ279582.1 · 51,719–52,120 bp · −
atpB · PQ279582.1 · 52,117–53,613 bp · −
psbJ · PQ279582.1 · 63,306–63,428 bp · −
psbL · PQ279582.1 · 63,566–63,682 bp · −
psbF · PQ279582.1 · 63,706–63,825 bp · −
psbE · PQ279582.1 · 63,840–64,091 bp · −
trnW-CCA · PQ279582.1 · 65,564–65,637 bp · −
trnP-UGG · PQ279582.1 · 65,789–65,862 bp · −
rpl20 · PQ279582.1 · 67,613–67,999 bp · −
rps12 · PQ279582.1 · 68,761–68,874 bp · −
rps12 · PQ279582.1 · 96,127–96,920 bp · −
clpP · PQ279582.1 · 69,006–70,875 bp · −
psbN · PQ279582.1 · 73,195–73,326 bp · −
rpoA · PQ279582.1 · 76,765–77,784 bp · −
rps11 · PQ279582.1 · 77,856–78,287 bp · −
rpl36 · PQ279582.1 · 78,375–78,488 bp · −
infA · PQ279582.1 · 78,584–78,823 bp · −
rps8 · PQ279582.1 · 78,946–79,359 bp · −
rpl14 · PQ279582.1 · 79,533–79,901 bp · −
rpl16 · PQ279582.1 · 80,028–81,319 bp · −
rps3 · PQ279582.1 · 81,466–82,128 bp · −
rpl22 · PQ279582.1 · 82,113–82,577 bp · −
rps19 · PQ279582.1 · 82,637–82,915 bp · −
rpl2 · PQ279582.1 · 82,968–84,458 bp · −
rpl23 · PQ279582.1 · 84,477–84,758 bp · −
trnI-CAU · PQ279582.1 · 84,924–84,997 bp · −
trnL-CAA · PQ279582.1 · 92,495–92,575 bp · −
ndhB · PQ279582.1 · 93,120–95,331 bp · −
rps7 · PQ279582.1 · 95,606–96,073 bp · −
trnN-GUU · PQ279582.1 · 107,027–107,098 bp · −
ndhF · PQ279582.1 · 108,488–110,710 bp · −
ndhD · PQ279582.1 · 113,436–114,956 bp · −
psaC · PQ279582.1 · 115,057–115,302 bp · −
ndhE · PQ279582.1 · 115,568–115,873 bp · −
ndhG · PQ279582.1 · 116,081–116,611 bp · −
ndhI · PQ279582.1 · 116,996–117,502 bp · −
ndhA · PQ279582.1 · 117,589–119,756 bp · −
ndhH · PQ279582.1 · 119,758–120,939 bp · −
rps15 · PQ279582.1 · 121,040–121,312 bp · −
ycf1 · PQ279582.1 · 121,699–127,191 bp · −
trnR-ACG · PQ279582.1 · 128,161–128,239 bp · −
rrn5 · PQ279582.1 · 128,469–128,589 bp · −
rrn4.5 · PQ279582.1 · 128,845–128,947 bp · −
rrn23 · PQ279582.1 · 129,046–131,856 bp · −
trnA-UGC · PQ279582.1 · 132,048–132,926 bp · −
trnI-GAU · PQ279582.1 · 132,991–133,999 bp · −
rrn16 · PQ279582.1 · 134,289–135,779 bp · −
trnV-GAC · PQ279582.1 · 136,007–136,078 bp · −
ycf15 · PQ279582.1 · 142,381–142,629 bp · −
ycf2 · PQ279582.1 · 142,672–149,529 bp · −
psbK · PQ279582.1 · 7,319–7,504 bp · +
psbI · PQ279582.1 · 7,888–7,998 bp · +
trnG-UCC · PQ279582.1 · 8,889–9,653 bp · +
trnR-UCU · PQ279582.1 · 9,827–9,901 bp · +
trnC-GCA · PQ279582.1 · 27,778–27,853 bp · +
petN · PQ279582.1 · 28,709–28,798 bp · +
psbD · PQ279582.1 · 32,407–33,468 bp · +
psbC · PQ279582.1 · 33,416–34,837 bp · +
psbZ · PQ279582.1 · 35,489–35,677 bp · +
trnG-GCC · PQ279582.1 · 35,904–35,974 bp · +
trnS-GGA · PQ279582.1 · 44,236–44,322 bp · +
trnL-UAA · PQ279582.1 · 46,349–46,922 bp · +
trnF-GAA · PQ279582.1 · 47,214–47,286 bp · +
trnM-CAU · PQ279582.1 · 51,429–51,501 bp · +
rbcL · PQ279582.1 · 54,400–55,866 bp · +
accD · PQ279582.1 · 56,556–58,022 bp · +
psaI · PQ279582.1 · 58,714–58,824 bp · +
ycf4 · PQ279582.1 · 59,263–59,817 bp · +
cemA · PQ279582.1 · 60,379–61,068 bp · +
petA · PQ279582.1 · 61,285–62,247 bp · +
petL · PQ279582.1 · 65,054–65,149 bp · +
petG · PQ279582.1 · 65,325–65,438 bp · +
psaJ · PQ279582.1 · 66,137–66,271 bp · +
rpl33 · PQ279582.1 · 66,744–66,944 bp · +
rps18 · PQ279582.1 · 67,092–67,397 bp · +
rps12 · PQ279582.1 · 137,695–138,488 bp · +
psbB · PQ279582.1 · 71,307–72,833 bp · +
psbT · PQ279582.1 · 73,027–73,134 bp · +
psbH · PQ279582.1 · 73,430–73,651 bp · +
petB · PQ279582.1 · 73,776–75,157 bp · +
petD · PQ279582.1 · 75,372–76,596 bp · +
ycf2 · PQ279582.1 · 85,086–91,943 bp · +
ycf15 · PQ279582.1 · 91,986–92,234 bp · +
trnV-GAC · PQ279582.1 · 98,537–98,608 bp · +
rrn16 · PQ279582.1 · 98,836–100,326 bp · +
trnI-GAU · PQ279582.1 · 100,616–101,624 bp · +
trnA-UGC · PQ279582.1 · 101,689–102,567 bp · +
rrn23 · PQ279582.1 · 102,759–105,569 bp · +
rrn4.5 · PQ279582.1 · 105,668–105,770 bp · +
rrn5 · PQ279582.1 · 106,026–106,146 bp · +
trnR-ACG · PQ279582.1 · 106,376–106,454 bp · +
rpl32 · PQ279582.1 · 111,216–111,392 bp · +
trnL-UAG · PQ279582.1 · 112,115–112,194 bp · +
ccsA · PQ279582.1 · 112,295–113,257 bp · +
trnN-GUU · PQ279582.1 · 127,517–127,588 bp · +
rps7 · PQ279582.1 · 138,542–139,009 bp · +
ndhB · PQ279582.1 · 139,284–141,495 bp · +
trnL-CAA · PQ279582.1 · 142,040–142,120 bp · +
trnI-CAU · PQ279582.1 · 149,618–149,691 bp · +
rpl23 · PQ279582.1 · 149,857–150,138 bp · +
rpl2 · PQ279582.1 · 150,157–151,647 bp · +
0 kb
13 kb
26 kb
39 kb
52 kb
65 kb
78 kb
91 kb
104 kb
117 kb
130 kb
143 kb
Panzerina lanata
ANNOTATED PLASTOME
PQ279582.1
151,741 bp · 132 genes
Gene function
Transfer RNA
Photosystem II
Other
Ribosomal protein
ATP synthase
RNA polymerase
Cytochrome
Photosystem I
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
0 37935 75870 113806 151741 bp
Forward strand 5′ → 3′
psbK psbI trnG-UCC trnR-UCU trnC-GCA petN psbD psbC psbZ trnG-GCC trnS-GGA trnL-UAA trnF-GAA trnM-CAU rbcL accD psaI ycf4 cemA petA petL petG psaJ rpl33 rps18 psbB psbT psbH petB petD ycf2 ycf15 trnV-GAC rrn16 trnI-GAU trnA-UGC rrn23 rrn4.5 rrn5 trnR-ACG rpl32 trnL-UAG ccsA trnN-GUU rps12 rps7 ndhB trnL-CAA trnI-CAU rpl23 rpl2
trnH-GUG psbA trnK-UUU matK rps16 trnQ-UUG trnS-GGA atpA atpF atpH atpI rps2 rpoC2 rpoC1 rpoB psbM trnD-GUC trnY-GUA trnE-UUC trnT-CGU trnS-UGA trnfM-CAU rps14 psaB psaA ycf3 rps4 trnT-UGU ndhJ ndhK ndhC trnV-UAC atpE atpB psbJ psbL psbF psbE trnW-CCA trnP-UGG rpl20 rps12 clpP psbN rpoA rps11 rpl36 infA rps8 rpl14 rpl16 rps3 rpl22 rps19 rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 rps12 trnN-GUU ndhF ndhD psaC ndhE ndhG ndhI ndhA ndhH rps15 ycf1 trnR-ACG rrn5 rrn4.5 rrn23 trnA-UGC trnI-GAU rrn16 trnV-GAC ycf15 ycf2
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
133 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
trnH-GUG gene − 2 75 74 Locate
psbA gene − 308 1366 1059 Locate
trnK-UUU gene − 1599 4186 2588 Locate
matK gene − 1901 3436 1536 Locate
rps16 gene − 5090 6234 1145 Locate
trnQ-UUG gene − 6911 6982 72 Locate
psbK gene + 7319 7504 186 Locate
psbI gene + 7888 7998 111 Locate
trnS-GGA gene − 8125 8212 88 Locate
trnG-UCC gene + 8889 9653 765 Locate
trnR-UCU gene + 9827 9901 75 Locate
atpA gene − 9998 11521 1524 Locate
atpF gene − 11609 12818 1210 Locate
atpH gene − 13183 13428 246 Locate
atpI gene − 14362 15105 744 Locate
rps2 gene − 15336 16046 711 Locate
rpoC2 gene − 16266 20456 4191 Locate
rpoC1 gene − 20611 23443 2833 Locate
rpoB gene − 23470 26682 3213 Locate
trnC-GCA gene + 27778 27853 76 Locate
petN gene + 28709 28798 90 Locate
psbM gene − 29587 29691 105 Locate
trnD-GUC gene − 30221 30294 74 Locate
trnY-GUA gene − 30410 30493 84 Locate
trnE-UUC gene − 30553 30625 73 Locate
trnT-CGU gene − 31192 31263 72 Locate
psbD gene + 32407 33468 1062 Locate
psbC gene + 33416 34837 1422 Locate
trnS-UGA gene − 35070 35162 93 Locate
psbZ gene + 35489 35677 189 Locate
trnG-GCC gene + 35904 35974 71 Locate
trnfM-CAU gene − 36123 36196 74 Locate
rps14 gene − 36346 36648 303 Locate
psaB gene − 36776 38980 2205 Locate
psaA gene − 39006 41258 2253 Locate
ycf3 gene − 41986 43919 1934 Locate
trnS-GGA gene + 44236 44322 87 Locate
rps4 gene − 44607 45212 606 Locate
trnT-UGU gene − 45598 45670 73 Locate
trnL-UAA gene + 46349 46922 574 Locate
trnF-GAA gene + 47214 47286 73 Locate
ndhJ gene − 47957 48451 495 Locate
ndhK gene − 48534 49211 678 Locate
ndhC gene − 49264 49626 363 Locate
trnV-UAC gene − 50588 51240 653 Locate
trnM-CAU gene + 51429 51501 73 Locate
atpE gene − 51719 52120 402 Locate
atpB gene − 52117 53613 1497 Locate
rbcL gene + 54400 55866 1467 Locate
accD gene + 56556 58022 1467 Locate
psaI gene + 58714 58824 111 Locate
ycf4 gene + 59263 59817 555 Locate
cemA gene + 60379 61068 690 Locate
petA gene + 61285 62247 963 Locate
psbJ gene − 63306 63428 123 Locate
psbL gene − 63566 63682 117 Locate
psbF gene − 63706 63825 120 Locate
psbE gene − 63840 64091 252 Locate
petL gene + 65054 65149 96 Locate
petG gene + 65325 65438 114 Locate
trnW-CCA gene − 65564 65637 74 Locate
trnP-UGG gene − 65789 65862 74 Locate
psaJ gene + 66137 66271 135 Locate
rpl33 gene + 66744 66944 201 Locate
rps18 gene + 67092 67397 306 Locate
rpl20 gene − 67613 67999 387 Locate
rps12 gene − 68761 68874 114 Locate
clpP gene − 69006 70875 1870 Locate
psbB gene + 71307 72833 1527 Locate
psbT gene + 73027 73134 108 Locate
psbN gene − 73195 73326 132 Locate
psbH gene + 73430 73651 222 Locate
petB gene + 73776 75157 1382 Locate
petD gene + 75372 76596 1225 Locate
rpoA gene − 76765 77784 1020 Locate
rps11 gene − 77856 78287 432 Locate
rpl36 gene − 78375 78488 114 Locate
infA gene − 78584 78823 240 Locate
rps8 gene − 78946 79359 414 Locate
rpl14 gene − 79533 79901 369 Locate
rpl16 gene − 80028 81319 1292 Locate
rps3 gene − 81466 82128 663 Locate
rpl22 gene − 82113 82577 465 Locate
rps19 gene − 82637 82915 279 Locate
rpl2 gene − 82968 84458 1491 Locate
rpl23 gene − 84477 84758 282 Locate
trnI-CAU gene − 84924 84997 74 Locate
ycf2 gene + 85086 91943 6858 Locate
ycf15 gene + 91986 92234 249 Locate
trnL-CAA gene − 92495 92575 81 Locate
ndhB gene − 93120 95331 2212 Locate
rps7 gene − 95606 96073 468 Locate
rps12 gene − 96127 96920 794 Locate
trnV-GAC gene + 98537 98608 72 Locate
rrn16 gene + 98836 100326 1491 Locate
trnI-GAU gene + 100616 101624 1009 Locate
trnA-UGC gene + 101689 102567 879 Locate
rrn23 gene + 102759 105569 2811 Locate
rrn4.5 gene + 105668 105770 103 Locate
rrn5 gene + 106026 106146 121 Locate
trnR-ACG gene + 106376 106454 79 Locate
trnN-GUU gene − 107027 107098 72 Locate
ndhF gene − 108488 110710 2223 Locate
rpl32 gene + 111216 111392 177 Locate
trnL-UAG gene + 112115 112194 80 Locate
ccsA gene + 112295 113257 963 Locate
ndhD gene − 113436 114956 1521 Locate
psaC gene − 115057 115302 246 Locate
ndhE gene − 115568 115873 306 Locate
ndhG gene − 116081 116611 531 Locate
ndhI gene − 116996 117502 507 Locate
ndhA gene − 117589 119756 2168 Locate
ndhH gene − 119758 120939 1182 Locate
rps15 gene − 121040 121312 273 Locate
ycf1 gene − 121699 127191 5493 Locate
trnN-GUU gene + 127517 127588 72 Locate
trnR-ACG gene − 128161 128239 79 Locate
rrn5 gene − 128469 128589 121 Locate
rrn4.5 gene − 128845 128947 103 Locate
rrn23 gene − 129046 131856 2811 Locate
trnA-UGC gene − 132048 132926 879 Locate
trnI-GAU gene − 132991 133999 1009 Locate
rrn16 gene − 134289 135779 1491 Locate
trnV-GAC gene − 136007 136078 72 Locate
rps12 gene + 137695 138488 794 Locate
rps7 gene + 138542 139009 468 Locate
ndhB gene + 139284 141495 2212 Locate
trnL-CAA gene + 142040 142120 81 Locate
ycf15 gene − 142381 142629 249 Locate
ycf2 gene − 142672 149529 6858 Locate
trnI-CAU gene + 149618 149691 74 Locate
rpl23 gene + 149857 150138 282 Locate
rpl2 gene + 150157 151647 1491 Locate
Status Available
Accession PQ279582.1
Length 151,741 bp
GC content 38.4%
Annotated genes 132
Gene sequence records 8
Translation Rna 37 Photosystem Ii 15 Other 14 Ribosomal Protein 26 Atp Synthase 6 Rna Polymerase 4 Cytochrome 6 Photosystem I 5 Nad Dehydrogenase 12 Ribosomal Rna 8
SSR 0
Direct 0
Inverted 2
Palindromic 0
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources