Salvia miltiorrhiza mitochondrial
Biopython GenomeDiagram 1.79; GenBank local location segments.
orf129a · NC_023209.1 · 413–802 bp · −
orf107a · NC_023209.1 · 4,433–4,756 bp · −
orf110a · NC_023209.1 · 4,889–5,221 bp · −
matR · NC_023209.1 · 5,874–7,829 bp · −
orf117a · NC_023209.1 · 7,986–8,339 bp · −
mttB · NC_023209.1 · 9,160–9,963 bp · −
cob · NC_023209.1 · 19,293–20,477 bp · −
rbcL · NC_023209.1 · 21,220–22,653 bp · −
trnM-CAU · NC_023209.1 · 25,528–25,600 bp · −
cox2 · NC_023209.1 · 27,268–31,115 bp · −
trnW-CCA · NC_023209.1 · 42,981–43,054 bp · −
nad9 · NC_023209.1 · 43,690–44,262 bp · −
orf104a · NC_023209.1 · 45,934–46,248 bp · −
orf124a · NC_023209.1 · 63,918–64,292 bp · −
nad2 · NC_023209.1 · 273,372–274,907 bp · −
orf104b · NC_023209.1 · 81,520–81,834 bp · −
trnP-UGG · NC_023209.1 · 86,763–86,837 bp · −
trnF-GAA · NC_023209.1 · 87,093–87,166 bp · −
trnS-GCU · NC_023209.1 · 87,516–87,603 bp · −
trnE-UUC · NC_023209.1 · 92,589–92,660 bp · −
orf154a · NC_023209.1 · 93,638–94,102 bp · −
orf109a · NC_023209.1 · 98,411–98,740 bp · −
atp1 · NC_023209.1 · 101,560–103,038 bp · −
orf196 · NC_023209.1 · 103,094–103,684 bp · −
orf131 · NC_023209.1 · 104,539–104,934 bp · −
rrn5 · NC_023209.1 · 106,118–106,229 bp · −
rrn18 · NC_023209.1 · 106,393–108,306 bp · −
orf144a · NC_023209.1 · 114,314–114,748 bp · −
orf112 · NC_023209.1 · 118,798–119,136 bp · −
rps10 · NC_023209.1 · 127,019–128,592 bp · −
ccmC · NC_023209.1 · 138,519–139,214 bp · −
rpl2 · NC_023209.1 · 143,201–144,584 bp · −
rpl23 · NC_023209.1 · 144,603–144,884 bp · −
trnI-CAU · NC_023209.1 · 145,050–145,123 bp · −
trnL-CAA · NC_023209.1 · 152,609–152,689 bp · −
ndhB · NC_023209.1 · 153,249–155,456 bp · −
rps7 · NC_023209.1 · 155,731–156,198 bp · −
orf116a · NC_023209.1 · 157,961–158,311 bp · −
orf102 · NC_023209.1 · 162,758–163,066 bp · −
orf140 · NC_023209.1 · 165,979–166,401 bp · −
rpl16 · NC_023209.1 · 168,331–168,807 bp · −
rps3 · NC_023209.1 · 168,734–171,937 bp · −
rps4 · NC_023209.1 · 172,443–173,498 bp · −
nad1 · NC_023209.1 · 179,746–180,132 bp · −
nad1 · NC_023209.1 · 450,710–452,278 bp · −
nad1 · NC_023209.1 · 265,963–266,220 bp · −
orf99a · NC_023209.1 · 189,466–189,765 bp · −
trnQ-UUG · NC_023209.1 · 190,127–190,198 bp · −
orf182a · NC_023209.1 · 193,201–193,749 bp · −
orf182b · NC_023209.1 · 193,968–194,516 bp · −
orf119a · NC_023209.1 · 194,935–195,294 bp · −
orf107b · NC_023209.1 · 195,405–195,728 bp · −
orf99b · NC_023209.1 · 197,193–197,492 bp · −
orf127 · NC_023209.1 · 206,785–207,168 bp · −
orf106c · NC_023209.1 · 208,560–208,880 bp · −
orf124b · NC_023209.1 · 210,245–210,619 bp · −
orf115a · NC_023209.1 · 213,175–213,522 bp · −
orf151 · NC_023209.1 · 224,974–225,429 bp · −
orf130 · NC_023209.1 · 237,655–238,047 bp · −
orf128a · NC_023209.1 · 238,116–238,502 bp · −
orf178b · NC_023209.1 · 238,507–239,043 bp · −
orf100a · NC_023209.1 · 256,505–256,807 bp · −
rps13 · NC_023209.1 · 267,057–267,407 bp · −
orf135 · NC_023209.1 · 271,208–271,615 bp · −
orf154b · NC_023209.1 · 271,992–272,456 bp · −
orf320 · NC_023209.1 · 279,937–280,899 bp · −
orf302 · NC_023209.1 · 280,904–281,812 bp · −
ccmFc · NC_023209.1 · 286,097–288,338 bp · −
orf298 · NC_023209.1 · 298,823–299,719 bp · −
orf104c · NC_023209.1 · 301,329–301,643 bp · −
orf113a · NC_023209.1 · 303,154–303,495 bp · −
orf143 · NC_023209.1 · 306,753–307,184 bp · −
orf126 · NC_023209.1 · 307,640–308,020 bp · −
orf119b · NC_023209.1 · 311,220–311,579 bp · −
nad4 · NC_023209.1 · 318,168–326,481 bp · −
orf111c · NC_023209.1 · 318,363–318,698 bp · −
rrn26 · NC_023209.1 · 331,830–334,736 bp · −
orf107c · NC_023209.1 · 352,616–352,939 bp · −
orf111b · NC_023209.1 · 368,256–368,591 bp · −
orf139 · NC_023209.1 · 371,886–372,305 bp · −
orf107d · NC_023209.1 · 375,882–376,205 bp · −
orf129b · NC_023209.1 · 382,826–383,215 bp · −
atp6 · NC_023209.1 · 383,298–384,266 bp · −
rps12 · NC_023209.1 · 395,061–395,438 bp · −
nad3 · NC_023209.1 · 395,487–395,843 bp · −
orf116b · NC_023209.1 · 404,027–404,377 bp · −
orf128c · NC_023209.1 · 407,081–407,467 bp · −
orf214 · NC_023209.1 · 420,498–421,223 bp · −
atp9 · NC_023209.1 · 421,253–421,477 bp · −
orf105 · NC_023209.1 · 424,617–424,934 bp · −
orf115c · NC_023209.1 · 452,530–452,877 bp · −
orf117b · NC_023209.1 · 454,757–455,110 bp · −
trnS-UGA · NC_023209.1 · 459,255–459,341 bp · −
orf456 · NC_023209.1 · 468,175–469,545 bp · −
ccmFn · NC_023209.1 · 472,283–474,022 bp · −
orf116d · NC_023209.1 · 477,870–478,220 bp · −
orf100c · NC_023209.1 · 480,473–480,775 bp · −
orf144b · NC_023209.1 · 481,635–482,069 bp · −
sdh4 · NC_023209.1 · 484,114–484,362 bp · −
cox3 · NC_023209.1 · 484,391–485,188 bp · −
atp8 · NC_023209.1 · 485,773–486,252 bp · −
trnK-UUU · NC_023209.1 · 488,874–488,946 bp · −
orf122c · NC_023209.1 · 490,237–490,605 bp · −
rpl10 · NC_023209.1 · 491,750–492,238 bp · −
atpB · NC_023209.1 · 23,438–24,934 bp · +
atpE · NC_023209.1 · 24,931–25,332 bp · +
orf192 · NC_023209.1 · 33,543–34,121 bp · +
nad5 · NC_023209.1 · 34,384–36,672 bp · +
nad5 · NC_023209.1 · 204,836–205,231 bp · +
nad5 · NC_023209.1 · 206,272–206,421 bp · +
orf101 · NC_023209.1 · 37,017–37,322 bp · +
orf106a · NC_023209.1 · 40,754–41,074 bp · +
petL · NC_023209.1 · 42,479–42,574 bp · +
petG · NC_023209.1 · 42,753–42,866 bp · +
orf268 · NC_023209.1 · 48,640–49,446 bp · +
nad6 · NC_023209.1 · 49,623–50,240 bp · +
orf208 · NC_023209.1 · 58,290–58,916 bp · +
trnC-GCA · NC_023209.1 · 63,146–63,216 bp · +
trnN-GUU · NC_023209.1 · 65,332–65,403 bp · +
trnY-GUA · NC_023209.1 · 66,126–66,208 bp · +
nad2 · NC_023209.1 · 66,725–68,544 bp · +
nad2 · NC_023209.1 · 70,346–70,534 bp · +
orf121 · NC_023209.1 · 67,034–67,399 bp · +
rrn26 · NC_023209.1 · 76,053–79,493 bp · +
trnfM-CAU · NC_023209.1 · 79,682–79,755 bp · +
orf169a · NC_023209.1 · 108,643–109,152 bp · +
rrn5 · NC_023209.1 · 115,216–115,334 bp · +
orf106b · NC_023209.1 · 119,262–119,582 bp · +
orf108a · NC_023209.1 · 128,869–129,195 bp · +
trnV-GAC · NC_023209.1 · 158,639–158,710 bp · +
trnH-GUG · NC_023209.1 · 161,656–161,730 bp · +
trnM-CAU · NC_023209.1 · 163,505–163,577 bp · +
orf178a · NC_023209.1 · 173,804–174,340 bp · +
orf137 · NC_023209.1 · 177,118–177,531 bp · +
orf152 · NC_023209.1 · 199,240–199,698 bp · +
orf120 · NC_023209.1 · 232,473–232,835 bp · +
orf114 · NC_023209.1 · 277,847–278,191 bp · +
orf123 · NC_023209.1 · 288,821–289,192 bp · +
orf115b · NC_023209.1 · 289,782–290,129 bp · +
nad4L · NC_023209.1 · 291,809–292,111 bp · +
atp4 · NC_023209.1 · 292,280–292,876 bp · +
trnI-CAU · NC_023209.1 · 295,240–295,313 bp · +
orf100b · NC_023209.1 · 304,167–304,469 bp · +
orf169b · NC_023209.1 · 309,498–310,007 bp · +
orf111a · NC_023209.1 · 312,426–312,761 bp · +
trnD-GUC · NC_023209.1 · 329,104–329,177 bp · +
trnS-GGA · NC_023209.1 · 329,706–329,792 bp · +
orf119c · NC_023209.1 · 330,914–331,273 bp · +
orf122a · NC_023209.1 · 336,090–336,458 bp · +
orf110b · NC_023209.1 · 339,830–340,162 bp · +
orf281 · NC_023209.1 · 342,326–343,171 bp · +
cox1 · NC_023209.1 · 343,457–346,001 bp · +
orf304 · NC_023209.1 · 344,264–345,097 bp · +
orf317 · NC_023209.1 · 346,261–347,214 bp · +
orf128b · NC_023209.1 · 356,685–357,071 bp · +
orf109b · NC_023209.1 · 367,720–368,049 bp · +
orf99c · NC_023209.1 · 369,376–369,675 bp · +
orf103a · NC_023209.1 · 391,624–391,935 bp · +
orf110c · NC_023209.1 · 397,321–397,653 bp · +
trnG-GCC · NC_023209.1 · 405,046–405,117 bp · +
rpl5 · NC_023209.1 · 411,821–412,375 bp · +
rps14 · NC_023209.1 · 412,377–412,661 bp · +
orf116c · NC_023209.1 · 416,068–416,418 bp · +
orf146 · NC_023209.1 · 419,328–419,768 bp · +
nad7 · NC_023209.1 · 427,546–432,260 bp · +
orf103b · NC_023209.1 · 427,900–428,211 bp · +
orf108b · NC_023209.1 · 433,962–434,288 bp · +
orf224 · NC_023209.1 · 446,330–447,004 bp · +
orf132 · NC_023209.1 · 467,202–467,600 bp · +
orf149 · NC_023209.1 · 471,644–472,093 bp · +
orf122b · NC_023209.1 · 475,270–475,638 bp · +
orf113b · NC_023209.1 · 486,767–487,108 bp · +
ccmB · NC_023209.1 · 490,822–491,442 bp · +
0 kb
42 kb
84 kb
126 kb
168 kb
210 kb
252 kb
294 kb
336 kb
378 kb
420 kb
462 kb
Salvia miltiorrhiza
ANNOTATED MITOGENOME
NC_023209.1
499,236 bp · 167 genes
Gene function
Other
Cytochrome
ATP synthase
Transfer RNA
NADH dehydrogenase
Ribosomal RNA
Ribosomal protein
0 124809 249618 374427 499236 bp
Forward strand 5′ → 3′
atpB atpE orf192 nad5 orf101 orf106a petL petG orf268 nad6 orf208 trnC-GCA trnN-GUU trnY-GUA nad2 orf121 nad2 rrn26 trnfM-CAU orf169a rrn5 orf106b orf108a trnV-GAC trnH-GUG trnM-CAU orf178a orf137 orf152 nad5 nad5 orf120 orf114 orf123 orf115b nad4L atp4 trnI-CAU orf100b orf169b orf111a trnD-GUC trnS-GGA orf119c orf122a orf110b orf281 cox1 orf304 orf317 orf128b orf109b orf99c orf103a orf110c trnG-GCC rpl5 rps14 orf116c orf146 nad7 orf103b orf108b orf224 orf132 orf149 orf122b orf113b ccmB
orf129a orf107a orf110a matR orf117a mttB cob rbcL trnM-CAU cox2 trnW-CCA nad9 orf104a orf124a orf104b trnP-UGG trnF-GAA trnS-GCU trnE-UUC orf154a orf109a atp1 orf196 orf131 rrn5 rrn18 orf144a orf112 rps10 ccmC rpl2 rpl23 trnI-CAU trnL-CAA ndhB rps7 orf116a orf102 orf140 rpl16 rps3 rps4 nad1 orf99a trnQ-UUG orf182a orf182b orf119a orf107b orf99b orf127 orf106c orf124b orf115a orf151 orf130 orf128a orf178b orf100a nad1 rps13 orf135 orf154b nad2 orf320 orf302 ccmFc orf298 orf104c orf113a orf143 orf126 orf119b nad4 orf111c rrn26 orf107c orf111b orf139 orf107d orf129b atp6 rps12 nad3 orf116b orf128c orf214 atp9 orf105 nad1 orf115c orf117b trnS-UGA orf456 ccmFn orf116d orf100c orf144b sdh4 cox3 atp8 trnK-UUU orf122c rpl10
Reverse strand 3′ ← 5′
Outer ring: forward strand; inner ring: reverse strand. The innermost ring shows overall GC percentage. GenBank gene locations may include introns; discontinuous parts are drawn separately. Hover for coordinates; click a segment to open its gene page. A circular layout does not establish a physical master-circle configuration. Biopython GenomeDiagram .
Gene-position browser Map and table selections are linked. Each row is one local segment; coordinates are 1-based and inclusive.
173 local segments
Gene Type Group Strand Start End Length
orf129a gene − 413 802 390 Locate
orf107a gene − 4433 4756 324 Locate
orf110a gene − 4889 5221 333 Locate
matR gene − 5874 7829 1956 Locate
orf117a gene − 7986 8339 354 Locate
mttB gene − 9160 9963 804 Locate
cob gene − 19293 20477 1185 Locate
rbcL gene − 21220 22653 1434 Locate
atpB gene + 23438 24934 1497 Locate
atpE gene + 24931 25332 402 Locate
trnM-CAU gene − 25528 25600 73 Locate
cox2 gene − 27268 31115 3848 Locate
orf192 gene + 33543 34121 579 Locate
nad5 gene + 34384 36672 2289 Locate
orf101 gene + 37017 37322 306 Locate
orf106a gene + 40754 41074 321 Locate
petL gene + 42479 42574 96 Locate
petG gene + 42753 42866 114 Locate
trnW-CCA gene − 42981 43054 74 Locate
nad9 gene − 43690 44262 573 Locate
orf104a gene − 45934 46248 315 Locate
orf268 gene + 48640 49446 807 Locate
nad6 gene + 49623 50240 618 Locate
orf208 gene + 58290 58916 627 Locate
trnC-GCA gene + 63146 63216 71 Locate
orf124a gene − 63918 64292 375 Locate
trnN-GUU gene + 65332 65403 72 Locate
trnY-GUA gene + 66126 66208 83 Locate
nad2 gene + 66725 68544 1820 Locate
orf121 gene + 67034 67399 366 Locate
nad2 gene + 70346 70534 189 Locate
rrn26 gene + 76053 79493 3441 Locate
trnfM-CAU gene + 79682 79755 74 Locate
orf104b gene − 81520 81834 315 Locate
trnP-UGG gene − 86763 86837 75 Locate
trnF-GAA gene − 87093 87166 74 Locate
trnS-GCU gene − 87516 87603 88 Locate
trnE-UUC gene − 92589 92660 72 Locate
orf154a gene − 93638 94102 465 Locate
orf109a gene − 98411 98740 330 Locate
atp1 gene − 101560 103038 1479 Locate
orf196 gene − 103094 103684 591 Locate
orf131 gene − 104539 104934 396 Locate
rrn5 gene − 106118 106229 112 Locate
rrn18 gene − 106393 108306 1914 Locate
orf169a gene + 108643 109152 510 Locate
orf144a gene − 114314 114748 435 Locate
rrn5 gene + 115216 115334 119 Locate
orf112 gene − 118798 119136 339 Locate
orf106b gene + 119262 119582 321 Locate
rps10 gene − 127019 128592 1574 Locate
orf108a gene + 128869 129195 327 Locate
ccmC gene − 138519 139214 696 Locate
rpl2 gene − 143201 144584 1384 Locate
rpl23 gene − 144603 144884 282 Locate
trnI-CAU gene − 145050 145123 74 Locate
trnL-CAA gene − 152609 152689 81 Locate
ndhB gene − 153249 155456 2208 Locate
rps7 gene − 155731 156198 468 Locate
orf116a gene − 157961 158311 351 Locate
trnV-GAC gene + 158639 158710 72 Locate
trnH-GUG gene + 161656 161730 75 Locate
orf102 gene − 162758 163066 309 Locate
trnM-CAU gene + 163505 163577 73 Locate
orf140 gene − 165979 166401 423 Locate
rpl16 gene − 168331 168807 477 Locate
rps3 gene − 168734 171937 3204 Locate
rps4 gene − 172443 173498 1056 Locate
orf178a gene + 173804 174340 537 Locate
orf137 gene + 177118 177531 414 Locate
nad1 gene − 179746 180132 387 Locate
orf99a gene − 189466 189765 300 Locate
trnQ-UUG gene − 190127 190198 72 Locate
orf182a gene − 193201 193749 549 Locate
orf182b gene − 193968 194516 549 Locate
orf119a gene − 194935 195294 360 Locate
orf107b gene − 195405 195728 324 Locate
orf99b gene − 197193 197492 300 Locate
orf152 gene + 199240 199698 459 Locate
nad5 gene + 204836 205231 396 Locate
nad5 gene + 206272 206421 150 Locate
orf127 gene − 206785 207168 384 Locate
orf106c gene − 208560 208880 321 Locate
orf124b gene − 210245 210619 375 Locate
orf115a gene − 213175 213522 348 Locate
orf151 gene − 224974 225429 456 Locate
orf120 gene + 232473 232835 363 Locate
orf130 gene − 237655 238047 393 Locate
orf128a gene − 238116 238502 387 Locate
orf178b gene − 238507 239043 537 Locate
orf100a gene − 256505 256807 303 Locate
nad1 gene − 265963 266220 258 Locate
rps13 gene − 267057 267407 351 Locate
orf135 gene − 271208 271615 408 Locate
orf154b gene − 271992 272456 465 Locate
nad2 gene − 273372 274907 1536 Locate
orf114 gene + 277847 278191 345 Locate
orf320 gene − 279937 280899 963 Locate
orf302 gene − 280904 281812 909 Locate
ccmFc gene − 286097 288338 2242 Locate
orf123 gene + 288821 289192 372 Locate
orf115b gene + 289782 290129 348 Locate
nad4L gene + 291809 292111 303 Locate
atp4 gene + 292280 292876 597 Locate
trnI-CAU gene + 295240 295313 74 Locate
orf298 gene − 298823 299719 897 Locate
orf104c gene − 301329 301643 315 Locate
orf113a gene − 303154 303495 342 Locate
orf100b gene + 304167 304469 303 Locate
orf143 gene − 306753 307184 432 Locate
orf126 gene − 307640 308020 381 Locate
orf169b gene + 309498 310007 510 Locate
orf119b gene − 311220 311579 360 Locate
orf111a gene + 312426 312761 336 Locate
nad4 gene − 318168 326481 8314 Locate
orf111c gene − 318363 318698 336 Locate
trnD-GUC gene + 329104 329177 74 Locate
trnS-GGA gene + 329706 329792 87 Locate
orf119c gene + 330914 331273 360 Locate
rrn26 gene − 331830 334736 2907 Locate
orf122a gene + 336090 336458 369 Locate
orf110b gene + 339830 340162 333 Locate
orf281 gene + 342326 343171 846 Locate
cox1 gene + 343457 346001 2545 Locate
orf304 gene + 344264 345097 834 Locate
orf317 gene + 346261 347214 954 Locate
orf107c gene − 352616 352939 324 Locate
orf128b gene + 356685 357071 387 Locate
orf109b gene + 367720 368049 330 Locate
orf111b gene − 368256 368591 336 Locate
orf99c gene + 369376 369675 300 Locate
orf139 gene − 371886 372305 420 Locate
orf107d gene − 375882 376205 324 Locate
orf129b gene − 382826 383215 390 Locate
atp6 gene − 383298 384266 969 Locate
orf103a gene + 391624 391935 312 Locate
rps12 gene − 395061 395438 378 Locate
nad3 gene − 395487 395843 357 Locate
orf110c gene + 397321 397653 333 Locate
orf116b gene − 404027 404377 351 Locate
trnG-GCC gene + 405046 405117 72 Locate
orf128c gene − 407081 407467 387 Locate
rpl5 gene + 411821 412375 555 Locate
rps14 gene + 412377 412661 285 Locate
orf116c gene + 416068 416418 351 Locate
orf146 gene + 419328 419768 441 Locate
orf214 gene − 420498 421223 726 Locate
atp9 gene − 421253 421477 225 Locate
orf105 gene − 424617 424934 318 Locate
nad7 gene + 427546 432260 4715 Locate
orf103b gene + 427900 428211 312 Locate
orf108b gene + 433962 434288 327 Locate
orf224 gene + 446330 447004 675 Locate
nad1 gene − 450710 452278 1569 Locate
orf115c gene − 452530 452877 348 Locate
orf117b gene − 454757 455110 354 Locate
trnS-UGA gene − 459255 459341 87 Locate
orf132 gene + 467202 467600 399 Locate
orf456 gene − 468175 469545 1371 Locate
orf149 gene + 471644 472093 450 Locate
ccmFn gene − 472283 474022 1740 Locate
orf122b gene + 475270 475638 369 Locate
orf116d gene − 477870 478220 351 Locate
orf100c gene − 480473 480775 303 Locate
orf144b gene − 481635 482069 435 Locate
sdh4 gene − 484114 484362 249 Locate
cox3 gene − 484391 485188 798 Locate
atp8 gene − 485773 486252 480 Locate
orf113b gene + 486767 487108 342 Locate
trnK-UUU gene − 488874 488946 73 Locate
orf122c gene − 490237 490605 369 Locate
ccmB gene + 490822 491442 621 Locate
rpl10 gene − 491750 492238 489 Locate
Status Available
Accession NC_023209.1
Length 499,236 bp
GC content 44.4%
Annotated genes 167
Gene sequence records 11
Other 101 Cytochrome 10 Atp Synthase 7 Translation Rna 22 Nad Dehydrogenase 16 Ribosomal Rna 5 Ribosomal Protein 12
SSR 86
Direct 33
Inverted 14
Palindromic 12
Sources and evidence boundary Accessions, release scope and coordinate evidence remain visible beside the visualization.
Full species sources